黄瓜绿斑驳花叶病毒海南分离物基因组测定与毒源分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王峰

作者： 王峰;任春梅;季英华;缪倩;姚恋秋;周益军;徐冬青;程兆榜

作者机构：

关键词： 黄瓜绿斑驳花叶病毒;基因组结构;遗传距离;进化树

期刊名称： 植物保护

ISSN： 0529-1542

年卷期： 2014 年 06 期

页码： 75-81

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为分析2012年采自海南西瓜上具黄瓜绿斑驳花叶病毒侵染典型症状的病毒分离物CGMMV-HaiN12的分子特征和可能来源,以病叶总RNA为模板,分3段进行RT-PCR扩增,测定了该分离物基因组全长序列。结果表明CGMMV-HaiN12基因组全长为6 425bp(GenBank登录号KC852074),与已报道的CGMMV分离物相比,除5′和3′端非编码区核苷酸数目略有不同外,编码区的基因结构完全相同。CGMMV-HaiN12全基因组序列与韩国分离物AF417242的相似性为99.6%、遗传距离为0.004,在进化树的末端两者聚为一支。将CGMMV-HaiN12与已发布的中日韩分离物的外壳蛋白基因序列进行遗传进化分析,所有分离物在0.000~0.027的遗传距离上聚为一支,显示这些分离物具有高度的相关性,而与欧洲的西班牙和俄罗斯的2个代表分离物具有较大差别。在进化树末端,CGMMV-HaiN12与3个韩国分离物(AJ245440、JF838188、AF417242)、2个我国湖南分离物(JQ715592、JQ715595)聚为一支,表明CGMMV-HaiN12可能由韩国传入,并且与传入我国湖南的分离物高度同源。在海南本地不进行西瓜制种的情况下,为控制CGMMV在海南的危害应加强对进入海南的西瓜和砧木种子的检疫工作。

分类号： S432.41

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