基于SSR分子标记的新疆83个常规陆地棉品种亲缘关系分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 牛清东

作者： 牛清东;杨延龙

作者机构：

关键词： 陆地棉;简单重复序列(simple repeated sequence,SSR);分子标记;亲缘关系;近似品种;群体结构分析;主成分分析;多态性

期刊名称： 中国棉花

ISSN： 1000-632X

年卷期： 2025 年 52 卷 007 期

页码： 32-37

摘要： 采用简单重复序列(simple repeated sequence,SSR)分子标记技术对 2022―2024 年新疆种业公司提交的 83 份样品(包括早熟品种、早中熟品种)进行亲缘关系分析,以期为棉花品种的管理和选择提供依据.使用农作物SSR数据比对软件(登记号:2025SR0343132)对样品 SSR 数据位点进行两两比较,分别利用 Powermarker V3.25、NTSYSpc-2.10e、Structure 2.3.4、GenALEx 6.502 进行SSR多态性分析、亲缘关系分析、群体结构分析和主成分分析.结果表明,60 对SSR引物共扩增出 153个等位变异,平均等位变异数为 2.55,平均多态性信息含量为 0.32.83 份品种两两比较共产生了 3 403 个组合,差异位点范围为 0~47,位点差异大于 2 的组合有 3 290 个,占组合数的 96.7%.亲缘关系分析、群体结构分析和主坐标分析的分类结果基本一致,83 份样品被划分为 2 个群体pop1 和pop2,pop2 包含pop2A和pop2B亚群.亲缘关系分析显示,棉种样品间的相似系数在 0.503~1.000,平均值为 0.690,说明棉种样品间遗传背景较窄、亲缘关系较近.主坐标分析结果显示:pop1 共有样品 15份,均为早熟品种;pop2A共有样品 52 份,其中含早熟品种 29 份、早中熟品种 23 份;pop2B共有样品 16 份,其中有早熟品种 9份、早中熟品种 7 份,并没有明显的地理分类特征.这些结果可为新疆棉花品种选育和管理提供参考.

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