橡胶树HbWD40基因家族的全基因组分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赵一杰

作者： 赵一杰;杜晓愚;张世鑫;袁红梅;晁金泉

作者机构：

关键词： 橡胶树;WD40;基因家族;表达模式;亚细胞定位

期刊名称： 植物生理学报

ISSN： 2095-1108

年卷期： 2023 年 59 卷 001 期

页码： 246-256

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： WD40是一类支架蛋白,广泛参与植物的生长发育、花青素的生物合成以及生物和非生物胁迫等生命活动.利用生物信息学技术,本研究从橡胶树基因组中鉴定到258个HbWD40家族成员,并对其染色体分布、蛋白保守结构域、组织特异性表达以及低温胁迫下的表达模式进行系统分析.结果显示,HbWD40成员在18条染色体上均有分布;根据结构域的不同可将HbWD40家族划分为28个亚族;表达模式分析发现有175个成员在所有5个组织中均有表达,并鉴定到8个在低温胁迫下差异表达的成员.利用RT-PCR技术克隆了橡胶树的HbWD40-168基因.该基因CDS长1335 bp,编码444个氨基酸.保守结构域分析显示HbWD40-168含有4个WD40重复元件和2个ZnF_C3H1锌指蛋白结构域.启动子分析显示HbWD40-168启动子区域存在多种激素或胁迫相关顺式作用元件.亚细胞定位显示HbWD40-168定位于细胞核.本研究为深入鉴定HbWD40家族在橡胶树中的生物学功能提供基础.

分类号： S794.1

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