基于转录组数据的青蛤微卫星标记开发与验证

文献类型： 中文期刊

第一作者： 方军

作者： 方军;沈彦鹏;张雷雷;李腾腾;邵艳卿

作者机构：

关键词： 海洋生物学;青蛤;微卫星标记;转录组

期刊名称： 应用海洋学学报

ISSN： 2095-4972

年卷期： 2020 年 39 卷 002 期

页码： 214-220

收录情况： CSCD

摘要： 本研究利用青蛤(Cyclina sinensis)的转录组信息开发微卫星标记,共获得12418个微卫星位点.其中单核苷酸重复次数最多,共8422个,占比67.08%;其次是三核苷酸重复,共1501个,占比12.09%;双核苷酸的重复有1419个,占比11.43%.在所有重复单元类型中,A/T重复出现频率最高,占单核苷酸重复的48.75%.随机选取81对引物进行微卫星标记验证,最终获得27个具有多态性的微卫星标记.对30个青蛤进行多态性位点检测和评价,共扩增到等位基因99个,每个位点的等位基因数Na为2~6个,期望杂合度He为0.0333~0.8085,观测杂合度Ho为0.0000~0.6786,多态信息含量(PIC)为0.0323~0.7645,有19个位点显著偏离Hardy-Weinberg平衡(p<0.01).本研究开发的微卫星标记为青蛤的分子遗传学研究、种质鉴定和自然种群资源保护等研究提供了基础数据.

分类号： P735%S917.4

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