蝴蝶兰腋芽增殖过程中的转录组特性

文献类型： 中文期刊

第一作者： 董晓宇

作者： 董晓宇;张晶;符真珠;张和臣;王利民;王慧娟;蒋卉;高杰;李艳敏

作者机构：

关键词： 蝴蝶兰;腋芽;转录组;基因表达

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2018 年 03 期

页码： 1265-1270

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 蝴蝶兰在种苗生产中主要是以腋芽再生的方式进行繁育。本研究以大辣椒、四季春2个蝴蝶兰品种为试材,利用Illumina Hi Seq-(TM)2000平台对他们在组织培养过程中3个诱导增殖阶段的转录组进行了测序。结果表明,测序共获得52.77 Gb的Clean Data,6个样品的Clean Data平均达到了6.78 Gb。对Clean Data进行过滤并组装,共获得86130条Unigenes;其中长度在1 kb以上的Unigenes有16723条。参照无参基因组在数据库中进行比对分析,其中28430条Unigenes可进行有效注释。对2个品种、3个诱导增殖阶段的全部Unigenes进行SNP分析表明,四季春的杂合性SNP分布密度明显低于大辣椒品种。另外,对转录组数据进行了差异表达基因分析,共获得了7638条差显基因。

分类号： S682.31

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