云南原始地方种四路糯基因组中的MITE类转座子"124"

文献类型： 中文期刊

第一作者： 武晓阳

作者： 武晓阳;杨亚洲;隆文杰;陈丹;周国雁;杜娟;伍少云;蔡青;黄兴奇

作者机构：

关键词： 糯玉米地方品种;四路糯;重测序;“124”转座子;起源演化

期刊名称： 安徽农业科学

ISSN： 0517-6611

年卷期： 2022 年 013 期

页码： 93-97

摘要： [目的]研究四路糯与普通玉米之间的亲缘关系。[方法]比较四路糯与B73基因组中“124”转座子的构成差异。[结果]在B73基因组中鉴定出13个“124”转座子序列和其插入位点信息；通过重测序得到约120 Gb的四路糯基因组序列，并从中鉴定出17个“124”转座子序列和其插入位点信息；在二者基因组中存在3个共同的“124”插入位点，这些位点展示出“124”转座子在序列和插入位点一致；B73基因组和四路糯基因组中均存在与waxy基因中“124”一致的转座子序列；建立的系统进化树可将“124”转座子归为4种类型，其中并没有单一基因组来源的类型。[结论]四路糯与B73基因组的差异是玉米种内的差异。

分类号： S513

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