高粱CIPK家族基因的全基因组鉴定及非生物胁迫下的表达特征
文献类型: 中文期刊
第一作者: 徐鹏
作者: 徐鹏;李春宏;范昕琦;梁笃;沈新莲
作者机构:
关键词: 高粱;CIPK基因;全基因组鉴定;非生物胁迫
期刊名称: 江苏农业学报
ISSN: 1000-4440
年卷期: 2024 年 004 期
页码: 591-598
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 钙调磷酸酶B样蛋白互作蛋白激酶(CIPK)是一种重要的Ca2+信号传感器,在植物应答逆境非生物胁迫过程中发挥着重要作用。为了探究高粱中CIPK家族基因的功能,本研究从高粱基因组中鉴定了31个SbCIPK基因,这些基因不均匀地分布在高粱的9条染色体上,编码蛋白质的氨基酸数量为403~519个,等电点为6.07~9.38,相对分子质量为46 357.31~58 316.97。基因结构分析结果表明,SbCIPK家族基因分为内含子缺失型和内含子富集型2类。进化树分析结果表明,SbCIPK家族蛋白质成员分为8个亚族。基于转录组数据的表达模式分析结果表明,SbCIPK基因广泛参与对盐胁迫、干旱胁迫等非生物胁迫的响应。本研究结果可以为高粱CIPK家族基因的功能研究奠定基础。
分类号: S514
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