茶小绿叶蝉CYP 6A14基因的克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李良德

作者： 李良德;王定锋;李慧玲;张辉;曾明森;吴光远

作者机构：

关键词： 茶小绿叶蝉;转录组;CYP6A14基因;校对;生物信息学

期刊名称： 茶叶学报

ISSN： 2096-0220

年卷期： 2018 年 01 期

页码： 1-5

摘要： 细胞色素P450(Cytochrome P450,CYP)是一类超家族基因,该基因对农药具有代谢解毒作用,致使昆虫产生抗药性,而CYP6是整个CYP家族中最重要的一族。本研究从前期获得的茶小绿叶蝉转录组数据库中筛选出了CYP6A14基因,通过RT-PCR对该基因的序列进行了校对,并运用一系列相应软件对该基因的生物信息学进行了分析。RT-PCR结果表明,所获得的基因片长1696bp,其中包含21bp的5′端序列,1467bp的编码区序列(编码488个氨基酸)和208bp的3′端序列。进化树分析结果表明,该基因与赤拟谷盗亲缘关系最近,与温室希蛛的亲缘关系最远。氨基酸比对结果表明,该基因编码的氨基酸与其他物种的保守性较差。三级结构模拟结果表明,CYP6A14蛋白主要由α螺旋组成。功能域预测结果表明,该基因具有一个p450蛋白域(Pfam:p450),而无信号肽(signal peptides)和跨膜结构(transmembrane structure)。该研究获得了茶小绿叶蝉CYP6A14基因的核苷酸序列,明确了该基因的基本生物学信息,为后续研究茶小绿叶蝉CYP6A14的分子功能奠定了基础。

分类号： S435.711

  • 相关文献

[1]茶小绿叶蝉代谢解毒基因CYP303A1的克隆及生物信息学分析. 李良德,王定锋,李慧玲,张辉,曾明森,吴光远. 2017

[2]高温胁迫下不同玉米花粉组蛋白Zm-H3基因的克隆及表达分析. 徐劲松,杨海鹏,张红梅,刘小红,郝耀山,孙毅. 2021

[3]基于高通量测序的麦红吸浆虫转录组分析. 蒋月丽,李彤,武予清,苗进,巩中军,段云,刘启航. 2020

[4]疥螨Sar s14.3过敏原蛋白原核表达及间接ELISA方法的建立. 李鑫,唐志强,张浩吉,唐文强,党志胜,孙悦翔,李静,叶碧锦,黄福强. 2023

[5]中泰南五味子转录组测序及生物信息学分析. 李静宇,徐友阳,蔡时可,王继华. 2022

[6]白菜型油菜IGT基因家族的鉴定与表达分析. 裴大妹,王龙,马茜茹,李华欣,肖麓. 2024

[7]基于RNA-Seq挖掘桃低温应答相关基因的研究. 李小兰1,2,郝兰兰1,2,张帆1,王鸿1,2. 2022

[8]鸟巢蕨转录组高通量测序及分析. 贾新平,孙晓波,邓衍明,梁丽建,叶晓青. 2014

[9]茶树PPR基因家族全基因组鉴定及白化相关基因表达分析. 刘丁丁,王君雅,汤榕津,陈亮,马春雷. 2021

[10]基于RNA-Seq分析茶树新品系‘春绿’生物信息. 林郑和,孔祥瑞,陈常颂,李鑫磊,张亚真,游小妹,陈志辉,单睿阳,钟秋生. 2023

[11]玫烟色棒束孢诱导的小菜蛾免疫响应表达谱分析. 雷妍圆,何余容,谢梅琼,吕利华,顾家睿. 2016

[12]"贵州茶叶"创刊简要的回忆. 汪桓武. 2012

[13]校对是期刊质量的保证——《杂交水稻》校对工作的一些体会. . 2004

[14]温室环境专用低功耗无线CO_2传感器与校对方法研究. 张馨,郭瑞,郑文刚,单飞飞,乔晓军. 2014

[15]科技期刊编译和校对工作的几个问题. 努尔来古丽·胡尔曼哈力. 1998

[16]农业科技论文编校中的问题探析. 潘小曼. 2017

[17]试谈科技期刊新编辑校对工作. 林海妹,孙继华,叶庆亮. 2013

[18]农业科技期刊英文参考文献著录常见差错分析. 胡成志,郝红梅,赵进春,翁维义,米文广. 2010

[19]学术期刊编辑校对环节核红的节点设置和关键要点. 柯文辉. 2021

[20]PDF在编辑工作中的应用. 张红林,胡昌平. 2001

作者其他论文 更多>>

微信小程序