基于ISSR和ITS分子标记的海南砂仁种质资源遗传多样性评价

文献类型: 中文期刊

第一作者: 罗 凡

作者: 罗 凡;瞿 云苹;陈 振夏;杨 涛;范 宇光;潘 坤

作者机构:

关键词: 海南砂仁;遗传多样性;遗传分化;ISSR;ITS;单倍型

期刊名称:

ISSN: 1000-8551

年卷期: 2025 年 39 卷 5 期

页码: 886-896

摘要: 为了对海南砂仁资源进行保护和管理,利用简单序列重复区间(ISSR)和核糖体RNA基因转录间隔区(ITS)技术,使用NTSYS、POPGENE、BioEdit和Clustalx等软件,分析了12个海南砂仁地理居群,共118份种质材料的遗传多样性和遗传分化程度。结果发现,ISSR引物筛选共获得25条多态性较高的引物,扩增获得132个位点,其中多态性位点93个,多态性比率达70.45%。通过对观测到的等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、居群内Nei’s基因多样性(H)、Shannon多样性信息指数(I)和基因流(Nm)统计,其平均值分别为1.164、1.103、0.059、0.087和0.271。基于海南砂ITS序列比对信息,检测出了11个单倍型,但在不同的居群中这些单倍型的分布不均匀,多个居群中仅检测出一种单倍型。上述结果表明,居群内的遗传多样性较低,不同地理居群的海南砂基因交流较少、遗传分化明显,居群间的遗传变异是其总遗传多样性的来源,由于居群间基因交流匮乏,已经导致海南砂居群内出现近交衰退。本研究可为海南砂种质资源的保护、利用和可持续开发提供科学依据。

分类号:

  • 相关文献

[1]15个白三叶品种的ISSR和ITS遗传多样性分析. 李金博,高丽华,周美亮,李诗刚,彭昭良,吴燕民. 2016

[2]新疆野生大环柄菇的分子鉴定与遗传多样性分析. 罗影,努尔孜亚·亚力买买提,贾文捷,刘洁莹,贾培松. 2023

[3]基于ITS和ISSR的灵芝种质资源遗传多样性分析. 许琳,张瑞,王胜,李金涛,刘琳玲,闫梅霞. 2023

[4]新疆野生平菇的遗传多样性分析. 罗影1,2,努尔孜亚·亚力买买提1,贾文捷1,朱琦1,石文婷2,李雨桐2,贾培松1. 2025

[5]内蒙古野生华北驼绒藜种群遗传多样性和遗传分化研究. 王普昶,赵丽丽,易津,张锦华. 2011

[6]三叶悬钩子自然居群遗传多样性的ISSR分析. 和志娇,和加卫,程在全,杨正松,杨洪涛,和文佳. 2012

[7]云南省5个雌雄异株工业大麻群体遗传结构评价. 陈璇,郭蓉,万睿璇,许艳萍,张庆滢. 2015

[8]120份小桐子种质的分子遗传多样性分析. 欧文军,王文泉,李开绵. 2009

[9]伞裙追寄蝇不同地理种群遗传多样性的ISSR分析. 王梦圆,韩海斌,王惠萍,岳方正,丛靖宇,刘爱萍. 2016

[10]新疆地区番茄潜叶蛾遗传多样性的ISSR分析. 李爱梅,付开赟,丁新华,何江,吐尔逊•阿合买提,冯宏祖,郭文超. 2022

[11]红泡刺藤居群的遗传多样性研究. 和志娇,和加卫,杨正松,程在全,杨燕林,李燕,黄杏娥. 2011

[12]云南不同土壤铅背景值下大叶茶种群对铅的吸收积累特征及其遗传分化. 刘声传,段昌群,李振华,梁名志,罗显扬. 2011

[13]泛希姬蝽不同地理种群的遗传多样性和遗传分化. 田小娟,唐艺婷,刘晨曦,张礼生,陈红印,王孟卿. 2019

[14]基于线粒体DNACOⅡ基因的亚洲玉米螟中国不同地理种群遗传分化及基因流研究. 张颖,王振营,何康来,王强. 2010

[15]基于线粒体DNA COⅡ基因的亚洲玉米螟中国不同地理种群遗传分化及基因流研究. 张颖,王振营,何康来,王强. 2010

[16]山东省二点委夜蛾不同地理种群遗传结构. 王静,于毅,陶云荔,李丽莉,褚栋. 2014

[17]基于线粒体DNA控制区序列分析我国马鹿5个亚种的遗传分化. 涂剑锋,徐佳萍,王洪亮,李一清,邢秀梅. 2018

[18]基于COⅠ基因片段的瓜实蝇遗传多样性分析. 张亚楠,龚治,牛黎明,李磊,张方平,韩冬银,符悦冠. 2017

[19]矿物油室温保存棉花黄萎菌的ISSR分析. 杨继娟,张吉光,胡小平,朱荷琴,杨家荣. 2010

[20]斑玉蕈种质资源评价及遗传多样性分析. 王红,刘俊杰,温浩,张鹏,曹君,肖军,黄竹青. 2023

作者其他论文 更多>>