小偃麦异附加系TaTGA4转录因子基因的克隆与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 牛祖彪

作者： 牛祖彪;李娜;惠文荣;宋静;黄春丽;高居荣;王洪刚;封德顺

作者机构：

关键词： 小偃麦异附加系;转录因子;Ta TGA4;基因克隆;生物信息分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2015 年 13 卷 01 期

页码： 91-97

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究利用Genefishing技术,从经过白粉病菌E09诱导处理12 h的高抗白粉病菌小偃麦(小麦-中间偃麦草异附加系)种质SN6306的c DNA中获得上调表达差异片段,经克隆测序,获得一个375 bp的序列。在NCBI数据库和小麦全长数据库Tri FLDB中进行相似性比对,预测其为TGA4转录因子的一段序列。设计序列的特异引物,经PCR扩增,从SN6306中克隆到小麦Ta TGA4基因的c DNA全长序列,并对该基因及其所编码的氨基酸序列进行了生物信息学分析。结果表明,Ta TGA4基因序列的开放阅读框长度为1 221 bp,编码含406个氨基酸残基的蛋白。BLASTP相似性比对分析显示,Ta TGA4含有b_ZIP1超家族与DOG1超家族两个保守结构域,且该蛋白与小麦的近缘物种节节麦中的同源蛋白一致性达到92%,与乌拉尔图小麦中的同源蛋白一致性达到90%。从多序列联配及系统进化树分析中可以推断出Ta TGA4属于TGA4转录因子类。本研究可为Ta TGA4基因在小麦抗白粉病中的功能研究打下基础。

分类号： S512.1

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