紫花苜蓿种子产量与大小相关性状全基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 徐明

作者： 徐明;蒋学乾;何飞;张帆;杨天辉;龙瑞才;杨青川;丛丽丽

作者机构：

关键词： 紫花苜蓿;全基因组关联分析;种子大小;种子产量

期刊名称： 草地学报

ISSN： 1007-0435

年卷期： 2024 年 32 卷 008 期

页码： 2419-2427

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 紫花苜蓿(Medicago sativa L.)作为一种营养价值高、适口性好的豆科牧草，在我国种植面积不断扩大，其优质种子的需求量也逐年增多。因此，提高单位面积的种子产量对我国紫花苜蓿产业的发展具有重要意义。为挖掘调控种子产量与外形的相关基因，本研究中，利用从世界各地收集的220份紫花苜蓿种子材料，对其种子重量(Seed weight, SW)、种子面积(Seed area, SA)、种子周长(Seed perimeter, SP)进行全基因组关联分析(Genome-wide association study, GWAS)。表型分析表明3个性状存在不同程度的变异，变异系数分别为10.96%(SW),8.31%(SA),4.43%(SP)。通过GWAS,共在7条染色体上发现20个与3个性状相关的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism, SNP)位点，单倍型分析证实了优异等位基因的数量与SW,SA和SP之间存在正相关性。对这20个显著SNP上下游各20 kb范围内的基因进行搜索注释，最终筛选到4个与种子产量和大小相关的候选基因。本研究的结果可为优化紫花苜蓿种子大小，提高种子产量的分子育种提供新的标记与候选基因。

分类号： S541.9

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