基于核心KASP标记的江苏粳稻品种DNA指纹图谱构建

文献类型： 中文期刊

第一作者： 朱小品

作者： 朱小品;徐婷婷;孟珊;杨雪;杨欣;朱银;狄佳春;郭春滨;王宁;颜伟

作者机构：

关键词： 水稻;KASP标记;DNA指纹图谱;品种鉴定;遗传多样性分析

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2024 年 40 卷 009 期

页码： 1569-1585

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了建立江苏粳稻品种DNA指纹图谱数据库，本研究利用水稻10K液相芯片对314份来源广泛的水稻种质资源进行SNP基因分型，筛选出一系列高多态性的SNP位点并开发出122个KASP标记。利用122个KASP标记对38份江苏粳稻品种进行检测，以多态性信息量(PIC)>0.3,最小等位基因频率(MAF)>0.2,检出率>0.9为筛选标准，筛选出56个具有高效鉴别效率的核心KASP标记。遗传距离相关性分析结果表明，基于56个核心KASP标记的江苏粳稻品种的遗传距离与基于122个高多态性KASP标记的的江苏粳稻品种的遗传距离相关系数为89.1%,呈极显著正相关(P<0.01),表明56个核心标记可以有效代替122个高多态性标记进行品种鉴定。进一步利用56个核心KASP标记对102份江苏粳稻品种的遗传多样性进行分析，并构建了102份品种的DNA指纹图谱和分子身份证二维码，本研究结果为江苏地区粳稻品种鉴定、选育和种质资源高效利用提供了参考。

分类号： S511.22

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