一株含有5个原噬菌体的单增李斯特菌比较基因组分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 王旭
作者: 王旭;李骏;张昭寰;潘迎捷;欧竑宇
作者机构:
关键词: 单增李斯特菌;比较基因组学;微进化;原噬菌体
期刊名称: 基因组学与应用生物学
ISSN: 1674-568X
年卷期: 2017 年 02 期
页码: 670-685
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 单增李斯特菌是一种重要的人畜共患病原菌,对食品安全和人类健康造成了严重威胁,但现阶段对其进化规律的研究仍相对较少。本研究运用Illumina测序技术对一株中国单增李斯特菌WaX12的基因组进行了测定,并通过比较基因组学分析了该菌的微进化规律。结果表明:WaX12的基因组与Finland 1998相似度最高,但两者基因组间存在135个基因的差异,主要集中在WaX12的原噬菌体上。进一步分析可知,WaX12的基因组携带5个原噬菌体,除原噬菌体1外,其余4个原噬菌体均未存在于Finland 1998中。原噬菌体3和原噬菌体5来源于其他单增李斯特菌的基因组,而原噬菌体2和原噬菌体4则分别来自于大肠杆菌和粪球菌。由此可见,原噬菌体是该单增李斯特菌微进化的主要原因,而这种微进化的发生不仅限于同一种属的细菌之间,还可能源于不同种属细菌间的基因转移。
分类号: R378`Q78
- 相关文献
[1]异尖科线虫线粒体基因组序列的生物信息学分析. 王旭,贾海燕,米荣升,黄燕,杨衡,张烨华,张晓丽,韩先干,陈兆国. 2018
[2]贵州南部柑桔黄龙病菌两个原噬菌体位点遗传多样性分析. 柏自琴,王小柯,冯建文,李金强,罗会,罗怿,李兴忠,李文云,马玉华. 2019
[3]中国柑橘黄龙病病原菌两个原噬菌体超变异基因遗传多样性. 谭锦,王雪峰,苏华楠,李中安,周常勇. 2013
[4]金针菇中单增李斯特菌生长预测模型的建立. 赵新,王永,刘娜,陈锐,朱珠,王成,兰青阔. 2016
[5]案板材质对单增李斯特菌在生熟食品间交叉污染的影响. 董庆利,陆冉冉,汪雯,刘阳泰,宋筱瑜,刘箐. 2016
[6]基于FSO值对生熟食品交叉污染中单增李斯特菌的危害识别. 董庆利,陆冉冉,汪雯,刘箐,江荣花. 2016
[7]单增李斯特菌hfq基因的克隆及分子特征分析. 彭叶龙,乔军,孟庆玲,谢堃,陈诚. 2014
[8]LPXTG基序蛋白lmo0160基因缺失对单增李斯特菌生物膜形成的影响. 张奇文,凌晨,马勋,薄新文,杜冬冬,钱凌霄,李红欢. 2017
[9]寡肽转运蛋白lmo2193基因缺失对单增李斯特菌环境适应性的影响. 李红欢,乔彦杰,康立超,杜冬冬,钱凌霄,李庆辉,王静,马勋. 2020
[10]LPXTG基序蛋白lmo0159基因缺失株的构建及对单增李斯特菌环境适应能力的影响. 张奇文,凌晨,杜冬冬,钱凌霄,李红欢,薄新文,马勋. 2018
[11]单增李斯特菌srtA基因缺失株的构建及srtA基因对其毒力的影响研究. 张奇文,凌晨,吴学林,马勋,薄新文. 2019
[12]单增李斯特菌耐药基因tetM、ermB接合转移. 李庆辉,康立超,李红欢,钱凌霄,阮婷玉,马勋. 2020
[13]56株食源性单增李斯特菌耐药性测定及耐药基因的检测. 李庆辉,康立超,杜冬冬,李红欢,钱凌霄,刘扬扬,马勋. 2019
[14]新疆食源性单增李斯特菌监测及血清型分析. 钱晶,杜冬冬,刘玉霞,殷月兰,王国红,罗瑞峰,黄新,张星星,康立超. 2020
[15]核糖核酸酶RnaseⅢ rncS基因缺失对单核细胞增生李斯特菌环境应激的调控作用研究. 王立霞,孟庆玲,乔军,蔡扩军,王登峰,伍晔晖,王熙凤,郭晶,才学鹏. 2018
[16]1株ST515型多重耐药单增李斯特菌全基因组测序分析. 杜冬冬,钱晶,常恒瑞,李红敏,魏向利,刘长勇,罗瑞峰,王国红,康立超. 2024
[17]单核细胞增生李斯特菌lmo0732基因克隆、分子特征及遗传进化分析. 李杰,张星星,乔梦凡,孟庆玲,乔军,李妍,王晓婷,李静,才学鹏. 2020
[18]接种量对单增李斯特菌生长/非生长界面的影响. 周小红,李学英,杨宪时,刘尊雷. 2016
[19]单增李斯特菌四环素耐药基因tetM膜接合转移的研究. 邵美丽,刘思国,尹录. 2010
[20]培养条件对单增李斯特菌生长的影响. 周小红,李学英,杨宪时,迟海. 2013
作者其他论文 更多>>
-
催化热解-金汞齐富集原子吸收光谱法测定土壤调理剂中汞
作者:柴玮玮;李雪;何倩丽;石洪玮;王旭;毛雪飞
关键词:催化热解;金汞齐;原子吸收光谱法;土壤调理剂;汞
-
1株B基因型牛副流感3型病毒的分离鉴定及全基因组序列分析
作者:张倩;王旭;韩猛立;张星星;吴桐忠;钟发钢;黄新;张乾义
关键词:牛副流感病毒3型;B基因型;分离鉴定;全基因组序列分析
-
异宗配合食用真菌双核体和单核体相关概念辨析
作者:鲍大鹏;徐建平;潘迎捷;谭琦
关键词:食用真菌;双核体;单核体;核相交替;性角色
-
呼伦贝尔岭东地区野生大豆资源分布和种群生境调查研究
作者:肖燕子;王旭;张宏斌;黄学文;姜超;刘欣雨;何立超;邓庆山;风润
关键词:呼伦贝尔岭东地区;野生大豆;资源调查
-
秸秆还田下氮素调控对盐碱地玉米根际土壤细菌群落多样性的影响
作者:李磊;李晓慧;樊丽琴;王旭;吴霞
关键词:盐碱地;氮素;土壤;速效养分;酶;细菌群落;群落结构;生物多样性
-
植物成花生理研究进展
作者:姜涛;王旭;张建春;于国庆;张学利;张日升
关键词:植物;成花;生理;植物激素
-
"稻+蒜"轮作栽培模式效益分析及高产高效栽培技术
作者:王芳;王旭;白文奎;徐雄;林春亮;李洪强
关键词:稻+蒜轮作;水稻;大蒜;高产高效栽培技术;水旱轮作