低温弱光胁迫下茄子幼苗实时荧光定量PCR内参基因的筛选与评价
文献类型: 中文期刊
第一作者: 林珲
作者: 林珲;裘波音;朱海生;温庆放
作者机构:
关键词: 茄子;内参基因;实时荧光定量PCR;标准化;基因表达
期刊名称: 福建农业科技
ISSN: 0253-2301
年卷期: 2024 年 55 卷 008 期
页码: 1-15
摘要: 为了探索茄子Solanum melongena L.的基因表达模式,利用qRT-PCR方法分析了茄子ACT、EF1α、TUA、TUB、GAPDH、eIF、UBQ、UBI3、PP2A、CYP、RPL28、L25、SAND、TBP、DNAJ、APRT、EXP、CAC、HSP20和CysPro 20个候选内参基因mRNA的表达差异情况,并运用GeNorm、NormFinder和BestKeeper 3种计算方法评价茄子20个候选内参基因在低温、弱光、低温弱光叶片样品中的表达稳定性。结果表明:茄子20个候选内参基因荧光定量引物扩增效率(E)数值在96.8%~117.6%,相关系数(R2)介于0.968 8~0.999 9,扩增效率良好,扩增反应具有高度的专一性,引物能特异性扩增,特异性好,均为单峰,样品间扩增曲线重复性强,可用于qRT-PCR扩增。茄子20个候选内参基因CT值表达丰度分析,发现茄子20个候选内参基因平均CT值在19.76~31.20。3种计算方法的综合评价分析结果显示,TBP基因在所有样本中为最稳定的内参基因。研究可为茄子低温、弱光和低温弱光胁迫下基因特异性表达研究提供了合适的内参基因。
分类号: S641.1
- 相关文献
[1]高温胁迫下茄子qRT-PCR内参基因筛选及稳定性分析. 李植良,罗少波,陈日远,金庆敏,黎振兴,李德明,孙保娟,孙光闻. 2017
[2]秋石斛RT-qPCR内参基因的筛选与验证. 侯天泽,易双双,张志群,王健,李崇晖. 2022
[3]民猪外周血单核细胞实时荧光定量PCR内参基因的筛选. 马红,刘宇,汪亮,王文涛,吴赛辉,何鑫淼,刘娣. 2017
[4]大白菜-结球甘蓝易位系实时荧光定量PCR内参基因的筛选. 崔菲菲,孟川,王彦华,赵建军,陈雪平,申书兴,顾爱侠. 2018
[5]稻粒黑粉病菌实时荧光定量PCR内参基因筛选. 盘林秀,王娜,王爱军,夏园,付成林,殷得所,郑爱萍. 2018
[6]银杏实时荧光定量PCR分析中内参基因的选择与验证. 苏西娅,石元豹,杨晓明,汪贵斌,曹福亮. 2019
[7]龙眼果实发育实时荧光定量PCR内参基因的筛选. 王淳璐,王彬,寇译丹,胡文舜,陈秀萍. 2021
[8]西红花实时荧光定量PCR内参基因筛选. 周琳,蔡友铭,杨柳燕,赵冰雪,李芳,张永春. 2020
[9]杜鹃红山茶实时定量PCR内参基因筛选及验证. 刘小飞,于波,黄丽丽,孙映波. 2020
[10]不同光质条件下刺葡萄红色愈伤组织的RT-qPCR内参基因筛选. 潘红,赖呈纯,张静,黄贤贵,林玉玲,赖钟雄. 2019
[11]栽培远志qRT-PCR内参基因筛选与P450s基因的时空表达分析. 李娟,孔冉冉,梅月菊,张福生,田洪岭,秦雪梅,杜晨晖,马存根. 2019
[12]萱草不同器官实时荧光定量PCR内参基因的筛选. 梁锦,刘海婷,钟荣,李昊,尹冬梅,刘翔,秦巧平,张志国,段可,倪迪安. 2020
[13]澳洲坚果实时荧光定量PCR分析中内参基因的筛选. 杨倩,杨子平,周娅丽,陈东泉,刘恒. 2020
[14]近零磁场下粘虫雌蛾内参基因转录表达稳定性评价. 闫蒙蒙,张蕾,程云霞,江幸福. 2021
[15]柠檬色百合实时荧光定量PCR内参基因筛选. 梁蕤,徐雷锋,毕蒙蒙,王静,唐玉超,郝泽慧,刘一洁,杨盼盼,明军,杜方. 2023
[16]杂交兰实时荧光定量PCR内参基因的筛选. 林榕燕,钟淮钦,黄敏玲,樊荣辉,吴建设. 2018
[17]钝裂银莲花花色素合成相关基因qRT-PCR内参基因的筛选. 马璐琳,段青,崔光芬,杜文文,贾文杰,王祥宁,王继华,陈发棣. 2021
[18]橡胶草实时荧光定量PCR内参基因评价. 覃碧,潘敏,余海洋,杨玉双,甘霖. 2016
[19]镰刀菌酸胁迫下节瓜实时荧光定量PCR分析内参基因的选择. 张金平,何晓明,江彪,谢大森,彭庆务,王永飞,马三梅. 2014
[20]长茎葡萄蕨藻胁迫条件下RT-qPCR内参基因的筛选与验证. 李恬静薇,邹潇潇,朱军,鲍时翔. 2021
作者其他论文 更多>>
-
花椰菜实时荧光定量PCR内参基因的筛选与评价
作者:林珲;裘波音;张前荣;李大忠;温庆放
关键词:花椰菜;内参基因;实时荧光定量PCR
-
干旱胁迫下南瓜CmGolS1表达量及相关生理指标的变化
作者:吴连周;程玉琦;陈敏氡;王彬;刘建汀;林锦辉;叶新如;曾美娟;温庆放;朱海生
关键词:南瓜;干旱;GolS;可溶性糖
-
冬瓜种子粗提物对白菜种子萌发和幼苗生长的影响及其内源抑制物分析
作者:叶新如;张前荣;陈敏氡;王彬;朱海生;温庆放
关键词:冬瓜;休眠特性;内源抑制物;GC-MS
-
苦瓜果实不同发育时期细胞壁组分及相关酶活性的差异分析
作者:裘波音;林珲;张前荣;李永平;温庆放;朱海生;李大忠
关键词:苦瓜;果实;发育;细胞壁组分;酶活性
-
普通丝瓜PYL基因家族鉴定及其在果实发育中的表达分析
作者:王玉倩;彭丽娟;刘建汀;温庆放;钟凤林;朱海生
关键词:普通丝瓜;PYL基因家族;果实发育;外源ABA处理;表达分析
-
外源钙离子对高温胁迫下草莓幼苗影响的转录组分析
作者:张圣美;裘波音;徐谦;黄宗安;罗天宽
关键词:草莓幼苗;CaCl2;高温胁迫;转录组
-
应用核酸分析仪鉴定茄子杂交种真实性及纯度
作者:林珲;黄建都;张前荣;陈继兵;温庆放
关键词:SSR;茄子;真实性鉴定;纯度检测;核酸分析仪