基于元分析的大豆含硫氨基酸相关基因挖掘与信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 邱红梅

作者： 邱红梅;厉志;于妍;高淑芹;马晓萍;郑宇宏;孟凡凡;侯云龙;王跃强

作者机构：

关键词： 大豆;含硫氨基酸;元分析;Meta-QTL;候选基因

期刊名称： 中国油料作物学报

ISSN： 1007-9084

年卷期： 2015 年 37 卷 02 期

页码： 141-147

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 提高含硫氨基酸组分是大豆品质改良的重要目标之一。本文借助Consensus Map 4.0高密度大豆遗传图谱,整合了33个含硫氨基酸QTL,并采用元分析方法,确定了8个含硫氨基酸Meta-QTL。通过QTL序列共线性区间分析,在Meta-QTL内筛选到7条用于候选基因发掘的基因组序列。利用基因功能注释,得到16个含硫氨基酸相关基因,包括6个氨基酸合成途径酶基因、1个11S大豆球蛋白A5A4B3亚基基因及9个调控基因。其中调控基因分别编码F-Box、PPR及转录因子3种蛋白。13个基因在NCBI数据库中分别有表达谱及SNP信息。大豆含硫氨基酸候选基因分析,可以为功能标记的开发和分子辅助育种提供有用信息。

分类号： S565.1

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