猪链球菌4型GalR蛋白的生物信息学分析及原核表达
文献类型: 中文期刊
第一作者: 孙珂
作者: 孙珂;祝昊丹;周俊明;王丹丹;俞正玉;吕立新;何孔旺;李彬;倪艳秀
作者机构:
关键词: 猪链球菌4型(SS4);转录调控因子GalR;生物信息学;原核表达
期刊名称: 中国畜牧兽医
ISSN: 1671-7236
年卷期: 2021 年 002 期
页码: 443-449
收录情况: 北大核心
摘要: 试验旨在了解猪链球菌4型(Streptococcus suis serotype 4,SS4)转录调控因子GalR蛋白生物学信息并对其进行原核表达。使用相关生物信息学分析网站对SS4 SH1510菌株GalR蛋白进行序列同源性和功能结构域检索,并对信号肽、跨膜区和等电点进行预测;同时,对SS4 SH1510菌株GalR基因进行扩增、原核表达、纯化,并用SDS-PAGE分析重组蛋白的可溶性,用Western blotting鉴定重组蛋白的反应原性。氨基酸序列比对显示,SH1510菌株GalR蛋白与变形链球菌、无乳链球菌、绿脓杆菌、马链球菌兽疫亚种、肺炎链球菌、口腔链球菌及李斯特菌的GalR家族蛋白的氨基酸序列分别具有57%、56%、55%、55%、52%、52%和49%的同源性;结构域检索发现GalR蛋白N-末端具有螺旋-转角-螺旋(helix-turn-helix,HTH)基序的小DNA结合结构域,C-末端具有Ⅰ型周质结合蛋白折叠的调节配体结合域,在这两个功能结构域的中间含有一个约18-氨基酸的连接子;GalR蛋白无信号肽,无跨膜区,等电点为5.10。SDS-PAGE分析显示,GalR蛋白绝大部分表达在上清,分子质量为56 ku;Western blotting鉴定结果显示,His单克隆抗体和粗制SS4多克隆抗体兔血清能特异性识别可溶性GalR蛋白。本研究对GalR蛋白进行了生物信息学分析并成功地表达和纯化了GalR蛋白,为进一步研究GalR蛋白在SS4中的作用奠定了基础。
分类号: S852.61
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