利用PCR-RFLP技术分析拟穴青蟹抗菌肽基因SCY2的SNP位点

文献类型： 中文期刊

第一作者： 马洪雨

作者： 马洪雨;马春艳;张丹;崔海玉;蒋科技;马凌波

作者机构：

关键词： 拟穴青蟹;SCY2基因;PCR-RFLP技术;单核苷酸多态性(SNP)

期刊名称： 武汉大学学报(理学版)

ISSN： 1671-8836

年卷期： 2011 年 04 期

页码： 343-349

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究根据公布的锯缘青蟹SCY2基因序列设计引物SCY2-RFLPs和SCY2-RFLPa,利用PCR-RFLP技术分析了5个地理群体(宁德、汕头、万宁、东方、三亚)共计148个拟穴青蟹SCY2基因的多态性.结果表明,所扩增的SCY2基因片段含有2个StuⅠ内切酶识别位点,位于第一外显子的位点没有多态性,位于第一内含子的位点存在多态性.在148个个体中共检测到AA和AB两种基因型,等位基因B的出现频率非常低,只在三亚群体的1个个体中检测到,而在其他4个群体中均未检测到,其等位基因频率为0.003 4.序列分析结果表明,扩增片段长度为1 016 bp,包含部分5′非翻译区(282 bp)、第一外显子(131 bp)和部分第一内含子(603 bp).AA基因型表现为3条带(从大到小依次为509,356,151 bp),AB基因型表现为4条带(从大到小依次为660,509,356,151bp).B等位基因是由于867 bp处发生了C→G的单碱基突变导致StuⅠ内切酶失去了1个识别位点而形成的.

分类号： S917.4

  • 相关文献

[1]利用等位基因特异性PCR技术检测番茄高色素基因hp1和hp2的单核苷酸多态性. 金凤媚,杨迎霞,薛俊,郏艳红,刘仲齐. 2009

[2]长顺绿壳蛋鸡的绿壳基因SNP标记的研究. 韩雪,粟朝芝,朱丽莉,顾永芬,陶宇航. 2015

[3]7个品种鸭MSTN基因5'-调控区单核苷酸多态性研究. 宋卫涛,朱文奇,徐文娟,李慧芳,陈宽维,韩威. 2013

[4]水稻抽穗期控制候选基因的SNP/InDel多态性分析. 闫双勇,谭振波,刘学军,苏京平,马忠友,孙林静,卢百关. 2005

[5]猪TLR4基因2个突变位点的PCR-SSCP分析. 陈月婵,翟春媛,刘娣,杨秀芹. 2012

[6]西藏冬青稞种质资源SNP标记的遗传多样性分析. 孟霞,曾兴权,其美旺姆,尼玛扎西. 2018

[7]基于SNP分子标记的澳洲坚果种质遗传多样性分析. 谭秋锦,王文林,陈海生,韦媛荣,郑树芳,黄锡云,贺鹏,夏志强. 2020

[8]基于简化基因组的甜叶菊分子标记开发. 孙雨茜,倪万潮,杜平,崔晓霞,郭书巧,蒋璐. 2020

[9]烟草开花期全基因组关联分析. 孙滢,姜自鹏,刘洪泰,孙明铭,蒋彩虹,任民,刘旦,罗朝鹏,张剑锋,杨军,杨爱国,程立锐. 2020

[10]影响猪生长和肉质性状的显著SNP在大约克和长白群体内的多态性分析. 王彦平,王怀中,姜运良,郭建凤,王继英. 2016

[11]野生‘龙门香橙’的植物学特征观察及起源研究. 曾继吾,姜波,吴波,钟云,程春振,母红娜,甘廉生,彭成绩,钟广炎,易干军. 2014

[12]SNP检测方法在动物研究中的应用. 赵杰,游新勇,徐贞贞,陈爱亮,赵燕,何雯菁,杨曙明. 2018

[13]玉米Rubisco活化酶基因ZmRCA1的序列变异分析. 宋燕春,石云素,程伟东,吴子恺,王天宇,黎裕. 2011

[14]猪重要性状全基因组关联分析的研究进展. 赵谦,浦亚斌,关伟军,赵倩君,马月辉. 2015

[15]高灌蓝莓CBF基因的单核苷酸多态性分析. 王甲威,林科,魏海蓉,刘庆忠. 2014

[16]茶树CHS基因结构及编码区单核苷酸多态性分析. 张丽群,韦康,王丽鸳,成浩,刘本英,龚武云. 2014

[17]滩羊肌肉抑制素(MSTN)基因TaqMan探针SNP分型及其与生长性状的关联研究. 马丽娜,李颖康,于洋,额尔和花,马青. 2016

[18]草鱼羧肽酶A1基因(CPA1)部分片段的单核苷酸多态性(SNP)多态性及其与生长性状的关联分析. 曹婷婷,白俊杰,于凌云,樊佳佳. 2012

[19]16个高丛越橘品种VcCBF基因的单核苷酸多态性(SNP)分析. 王甲威,林科,姜超,魏海蓉,刘庆忠. 2012

[20]大口黑鲈高密度脂蛋白结合蛋白基因(HBP)SNPs的筛选及与生长性状关联性分析. 周春龙,白俊杰,李胜杰,樊佳佳,马冬梅. 2014

作者其他论文 更多>>

微信小程序