单细胞转录组测序技术及其在肌内脂肪细胞研究中的应用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张久盘

作者： 张久盘;马青;王锦;马丽娜;魏大为;梁小军

作者机构：

关键词： 单细胞转录组测序;肌内脂肪细胞;细胞异质性

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2023 年 002 期

页码： 479-489

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 单细胞转录组测序（single-cell RNA sequencing, scRNA-seq）技术在单细胞水平对转录组进行测序，可从表达量、细胞量及细胞组成等多种角度描述样本，主要包括单细胞分离、mRNA反转录、文库构建、转录组测序和数据分析等步骤。单细胞分离是scRNA-seq技术操作的第一步，常用的细胞分离方法有连续稀释法、显微操作法、荧光激活流式细胞术、激光捕获显微切割术和微流控技术。基于不同细胞捕获、cDNA扩增和文库构建开发了许多scRNA-seq方法，如CEL-seq2、Drop-seq、MARS-seq、SCRB-seq、Smart-seq、Smart-seq2等。与传统测序方法相比，scRNA-seq可识别单个细胞的基因表达信息、记录细胞的空间位置、跟踪不同细胞谱系在分化过程中的轨迹，这为研究难以大量提取的肌内脂肪细胞分子特异性和发生分化过程带来极大便利。作者简要介绍了scRNA-seq技术的关键步骤，比较分析了单细胞分离和转录组测序方法的优缺点，综述了肌内脂肪细胞的起源以及scRNA-seq在肌内脂肪细胞的亚群和标记基因鉴定以及细胞分化轨迹追踪中的应用，以期为肌内脂肪细胞的深入研究提供参考依据。

分类号： Q811.4

  • 相关文献

[1]单细胞转录组测序技术发展及其在甘薯中的应用. 赵楠,梁雪莲,谢淑燕,张新新,马婷婷,邹宏达,陈景益,房伯平,黄立飞. 2023

[2]基于单细胞转录组测序的鹿茸生长中心细胞异质性研究. 丁宁,张然然,范广轩,邢秀梅,刘欣. 2024

[3]C-型利钠肽调控鸡肌内脂肪细胞脂肪沉积的作用机制研究. 黄华云,梁忠,刘龙洲,赵振华,王钱保,李春苗,黄正洋,张欣,黎寿丰. 2020

[4]单细胞RNA测序技术在病毒研究中的应用. 屈亮,李素,仇华吉. 2020

[5]单细胞转录组测序技术及其在植物研究中的应用. 陈柳宏,赵春雷,王希,李彦丽,丁广洲,陈丽. 2022

[6]单细胞测序技术及其在毛囊发育中的应用. 叶娜,张晓兰,包鹏甲,王兴东,阎萍,潘和平. 2021

[7]单细胞转录组测序在植物组织发育研究中的应用. 苗龙,汪文辉,何艮华,李佳佳,高慧慧,王晓波,邱丽娟. 2023

作者其他论文 更多>>

微信小程序