甘蓝型油菜作图群体亲本基因组及性状QTL密集区变异特点

文献类型： 中文期刊

第一作者： 程明星

作者： 程明星;童超波;程晓晖;刘越英;刘立江;柴国华;黄军艳;刘胜毅

作者机构：

关键词： 油菜;作图群体;亲本;基因组变异特点;QTL

期刊名称： 中国油料作物学报

ISSN： 1007-9084

年卷期： 2017 年 04 期

页码： 427-436

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了解作图群体亲本间基因组和密集QTL区的遗传变异,促进QTL定位与克隆,本研究对一个甘蓝型油菜(Brassica napus)重组自交系(recombinant lnbred lines,RIL)群体双亲M083和888-5(二者株高、分枝数、开花时间、菌核病抗性等性状差异显著)的基因组进行深度测序和分析。研究结果表明:在M083和888-5中分别检测到SNP个数为1 941 397和2 046 009,In Del个数为410 961和428 572,结构变异个数为90 384和88 456,拷贝数变异个数为46 655和46 008。对包含开花时间、菌核病抗性、株高等多个性状主效QTL密集的A02染色体进行分析发现,在包括上述性状QTL密集的6.4~6.9Mb的0~8.5Mb基因组区间内,两品系SNPs和In Dels变异数量/密度总体呈相反的趋势;片段丢失也有热点区,888-5和M083均在两个共同区域高频发生,其中一个为QTL密集区;倒位在染色体上的分布虽然也是不均匀的,但两品种间发生区域不同,且与QTL无关。本文关于基因组变异(SNPs、In Dels、除倒位外的结构变异)热点区和QTL密集区重复的结论对性状控制位点精细定位、基因克隆及育种亲本选择有一定的指导意义。

分类号： S565.4

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