六点始叶螨内参基因筛选及其在超氧化物歧化酶基因EsSOD表达分析中的应用
文献类型: 中文期刊
第一作者: 梁晓
作者: 梁晓;陈青;伍春玲;方永军
作者机构:
关键词: 六点始叶螨;内参基因;超氧化物歧化酶基因EsSOD;基因表达
期刊名称: 热带作物学报
ISSN:
年卷期: 2021 年 001 期
页码: 175-181
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为了筛选稳定内参基因分析六点始叶螨超氧化物歧化酶基因EsSOD的表达量,本研究采用geNorm、Bestkeeper、Normfinder和RefFinder软件分析6个候选内参基因actin、gapdh、rpl13、α-tub、β-tub和18sRNA在六点始叶螨幼螨、前若螨、后若螨和雌成螨中的表达稳定性。结果表明,根据geNorm软件分析得出6个候选内参引物的稳定性从大到小的排序为:actin>β-tub>rpl13>α-tub>gapdh>18sRNA;根据NormFinder软件分析得出的稳定性从大到小的排序为:rpl13>β-tub>actin>α-tub>18sRNA>gapdh;根据BestKeeper软件分析得出的稳定性从大到小的排序为:β-tub>rpl13>actin>gapdh>α-tub>18sRNA;最终根据RefFinder软件的综合分析结果,actin和β-tub是稳定性最佳的2个内参引物。分别以actin和β-tub为内参进行EsSOD基因表达量的RT-qPCR分析,结果表明,与取食感螨橡胶树种质’IAN2904’后EsSOD表达量相比,不同龄期六点始叶螨取食抗螨橡胶树种质’IRCI12’后EsSOD表达量均降低。本研究获得了可用于六点始叶螨EsSOD表达量分析的稳定内参引物,为橡胶树种质抗螨性分子机理研究奠定了理论基础。
分类号: S763.7
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