基于SLAF-seq技术的苦瓜白粉病SNP分子标记开发

文献类型： 中文期刊

第一作者： 冯诚诚

作者： 冯诚诚;黄如葵;黄熊娟;陈小凤;黄玉辉;梁家作;刘杏连;王齐旭

作者机构：

关键词： 苦瓜;白粉病;SLAF-seq;SNP分子标记;ARMS-PCR

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2018 年 01 期

页码： 108-115

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以高抗白粉病苦瓜MC18和高感白粉病MC105杂交构建遗传分离群体,利用SLAF-seq技术进行深度测序,开发与抗白粉病性状紧密关联的SNP分子标记。结果表明:测序共获得各样品的有效reads为10.48 Mb,获得高质量的SLAF标签91 856个,其中多态性SLAF标签5 502个,多态性比例为5.99%。通过对多态性SLAF标签进行关联分析,筛选出与苦瓜白粉病抗病性状紧密关联的SNP位点共29个。根据关联分析结果 ,通过四引物扩增受阻突变体系PCR技术进行SNP位点多态性的验证,其中Marker4542、Marker11188分子标记特异性强、灵敏度高、稳定性好,建立一套简便快捷的苦瓜SNP分型方法。该方法可对苦瓜育种材料进行分子标记辅助选择,以进一步提高苦瓜抗病育种效率。

分类号： S436.429

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