大蕉果实转录组学分析及类胡萝卜素合成相关基因的研究
文献类型: 中文期刊
第一作者: 韩树全
作者: 韩树全;罗立娜;魏鹏程;卢振亚;贺尔奇;刘凡值
作者机构:
关键词: 大蕉;转录组;类胡萝卜素;转录因子
期刊名称: 种子
ISSN: 1001-4705
年卷期: 2024 年 005 期
页码: 24-32,77
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为探究大蕉果实不同发育时期在转录水平上的变化及类胡萝卜素生物合成代谢的差异表达基因,本研究以幼果期(BGZ1)、成熟期(BGZ2)、后熟期(BGZ3)的大蕉果实为研究对象,借助转录组测序技术进行分析。差异表达基因分析结果显示,BGZ1 vs BGZ2、BGZ1 vs BGZ3和BGZ2 vs BGZ3差异表达基因数目分别为3 828个、16 138个和14 923个。GO分类和富集分析显示,3个差异分组主要富集在代谢过程、发育过程、结合、催化活性、细胞解剖实体等。KEGG分析结果表明,3个差异分组中,与类胡萝卜素的合成代谢相关的代谢途径、次生代谢产物的生物合成途径富集比较多。BGZ1 vs BGZ2、BGZ2 vs BGZ3分别有556个、1 507个显著差异表达的转录因子,BGZ1 vs BGZ2显著差异表达的转录因子中下调表达居多。参与大蕉果实类胡萝卜素合成代谢的差异候选基因有37个,与BGZ1相比,BGZ2有12个基因上调表达、27个基因下调表达;与BGZ2相比,BGZ3有17个基因上调表达、20个基因下调表达。3个PSY候选基因的表达量在BGZ3时期降低;LCYE和LCYB在后熟期具有较高基因表达量。研究结果为大蕉中类胡萝卜素代谢的分子调控机制提供参考。
分类号: S668.1
- 相关文献
[1]柚芽变株系类胡萝卜素代谢差异基因的转录组学分析. 潘鹤立,潘腾飞,佘文琴,徐世荣,李小婷,黄汉唐,陈源,吴少华,潘东明. 2020
[2]辣椒果实类胡萝卜素调控因子转录组和靶向代谢组分析. 段敏杰,李怡斐,王春萍,杨小苗,黄任中,黄启中,张世才. 2024
[3]2种大蕉发育过程类胡萝卜素代谢分析. 韩树全,罗立娜,魏鹏程,卢振亚,刘凡值. 2024
[4]辣椒不同发育时期果实着色的转录组分析. 秦于玲,申龙斌,曹振木. 2020
[5]黄肉猕猴桃中果皮和内果皮不同时期比较转录组分析. 李明章,孙淑霞,李靖,陈栋,宋海岩,江国良,廖明安. 2019
[6]黄肉苹果转色期前后类胡萝卜素合成相关差异表达基因鉴定. 宋成秀,张利义,张彩霞,田义,丛佩华. 2017
[7]兰花花色化学及相关功能基因研究进展. 李崇晖,仇键,杨光穗,王存,黄素荣. 2013
[8]烟叶衰老过程中类胡萝卜素代谢及相关基因表达分析. 文利超,吴凤燕,李伟,郭永峰. 2019
[9]猕猴桃果肉颜色性状基因及其EST-SSR标记发掘. 孙淑霞,涂美艳,李靖,陈栋,宋海岩,徐子鸿,廖明安,李明章,江国良. 2025
[10]低温胁迫下苦瓜叶片转录组差异基因分析及生理响应特征. 杜文丽,陈中钐,许端祥,徐同伟,高山,温庆放. 2021
[11]黄麻(Corchorus capsularis L.)干旱胁迫转录组初步分析. 金关荣,陈杰,安霞. 2020
[12]紫花苜蓿响应低温胁迫转录因子的鉴定及表达分析. 齐晓,闵学阳,张正社,孙启忠,刘文献. 2017
[13]基于转录组分析不同着色桃果皮花青苷表达模式与转录因子. 何平,李林光,王海波,常源升. 2019
[14]盐胁迫条件下花生转录因子表达分析. 赵小波,闫彩霞,李春娟,王娟,姜常松,单世华. 2017
[15]木豆响应低温胁迫差异表达基因分析. 唐军,丁西朋,陈志坚,马向丽,毕玉芬,郭凤根. 2022
[16]旱胁迫和复水处理后马铃薯转录因子的转录组分析. 巩檑,张丽,聂峰杰,陈虞超,甘晓燕,石磊,宋玉霞,郭志乾,王峰. 2015
[17]低温胁迫下枇杷不同发育阶段的花果转录组比较分析. 徐红霞,周慧芬,李晓颖,姜路花,陈俊伟. 2021
[18]全基因组DNA甲基化和转录组联合分析鉴定杜梨耐盐相关转录因子. 李慧,张雨峰,李晓刚,王中华,蔺经,常有宏. 2023
[19]低氮胁迫下芝麻差异表达转录因子基因的分析. 张鹏钰,苏小雨,高桐梅,李丰,田媛,王东勇,卫双玲. 2023
[20]叶面喷施脱落酸对黄瓜果实品质的影响. 梁颖,张泽锦,王力明,唐丽,高佳. 2023
作者其他论文 更多>>
-
CRISPR/Cas基因编辑技术在抗除草剂作物育种中的研究进展
作者:童朝云;黄宇婷;杨靖茹;王智睿;刘小双;李娟;魏鹏程
关键词:CRISPR/Cas;精准编辑;除草剂;水稻;抗性基因
-
杧果园土壤微生物生物量碳、氮、磷生态化学计量特征探究
作者:刘荣;林迓;刘凡值
关键词:杧果园;微生物生物量碳;微生物生物量氮;微生物生物量磷;生态化学计量
-
2种大蕉发育过程类胡萝卜素代谢分析
作者:韩树全;罗立娜;魏鹏程;卢振亚;刘凡值
关键词:大蕉;果肉;橙黄肉;白肉;类胡萝卜素;代谢途径
-
香蕉吸芽的特征特性及除芽技术研究进展
作者:罗立娜;韩树全;易正帮;齐兴贵;魏鹏程;卢振亚
关键词:香蕉;吸芽;特征特性;除芽技术
-
册亨县香蕉主要病虫害调查
作者:罗立娜;韩树全;齐兴贵;易正帮;贺尔奇;魏鹏程
关键词:香蕉;病虫害;危害症状;危害程度;综合防控技术;贵州册亨
-
7个澳洲坚果品种幼树生长适应性评价与分析
作者:卢振亚;韩树全;罗立娜;魏鹏程
关键词:澳洲坚果;地径;冠幅
-
香蕉主要病虫害及防治措施研究进展
作者:杨亚娥;卢加举;王忠泽;刘凡值;罗立娜
关键词:香蕉病虫害;发生情况;危害症状;病原;防治措施;问题;展望;研究进展