绵羊季节性发情性状核心基因和关键lncRNA的筛选与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨杨

作者： 杨杨;李良远;万鹏程;卢守亮;刘长彬;杨华;王立民;代蓉;周平

作者机构：

关键词： 绵羊;季节性发情;RNA-seq;核心基因;lncRNA

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2025 年 56 卷 003 期

页码： 1264-1277

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在筛选与季节性发情相关的核心基因和长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)。本研究选取2～3岁空怀的中国美利奴羊和湖羊母羊(乏情期、发情期和发情间期各3只),采集卵巢组织样本，采用RNA-seq技术筛选差异表达的基因(differentially expressed genes, DEGs)和lncRNAs,并通过GO、KEGG富集分析、PPI分析及ceRNA网络构建鉴定与繁殖性能相关的核心基因和lncRNAs。结果，构建了6个不同生理状态下的RNA文库，筛选得到1 495个差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)和454个差异表达lncRNAs,其中共性DEGs和lncRNAs分别为313个和435个，特有DEGs和lncRNAs分别为1 182个和19个。GO和KEGG富集分析显示，共性DEGs在细胞分裂和细胞周期等方面显著富集，而差异表达的lncRNAs靶基因富集于细胞内信号转导及负调控RNA聚合酶II启动子转录等。特有DEGs在细胞迁移的正向调节中富集，lncRNAs的靶基因集中于细胞间粘附和整合素介导的信号通路等。通过PPI筛选出19个核心基因，主要富集在卵母细胞减数分裂和细胞周期信号通路。聚类分析结果显示，核心基因在乏情期表达量较高。ceRNA网络进一步揭示基因在细胞周期等信号通路的富集。RT-qPCR验证结果与高通量测序一致。筛选出19个核心基因和28个lncRNAs,并发现42个lncRNA-miRNA-mRNA靶向关系，为理解绵羊季节性繁殖的分子机制提供了潜在调控靶点。

分类号： S826

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