基于荧光标记的茶树花转录组序列SSR标记开发

文献类型： 中文期刊

第一作者： 邓少春

作者： 邓少春;陈林波;田易萍;陈春林;徐丕忠;李朝云;梁名志

作者机构：

关键词： 茶树花;转录组;SSR;荧光标记

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2018 年 18 期

页码： 6001-6008

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究对204 199条茶树花转录组Unigenes进行SSR简单重复序列的查找,得到含有SSR的序列60 581个,出现频率为29.67%。EST-SSR重复类型以单核苷酸和二核苷酸为主,占总SSR比例的85.69%,其中主要重复基序类型为单核苷酸,占总SSR的47.97%,A/T重复类型出现最多。采用荧光标记PCR技术对设计合成的100对SSR引物进行引物筛选,其中有28对引物扩增条带清晰、多态性好,在4个品种的茶树花中得到有效性验证。结果表明,茶树花转录组的SSR标记开发是可行的,这些EST-SSR的开发对茶树花遗传多样性分析、分子育种和开发茶树不育相关的SSR标记等具有重要意义。

分类号： S571.1

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