A型塞内卡谷病毒SDMY-CH-2021的分离鉴定及全基因组序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李世恒

作者： 李世恒;辛忠昊;郭效珍;路晓;林仲寅;马秀丽;黄兵;格日勒图

作者机构：

关键词： A型塞内卡谷病毒;分离;鉴定;全基因组;VP1蛋白;遗传演化分析

期刊名称： 黑龙江畜牧兽医

ISSN： 1004-7034

年卷期： 2024 年 021 期

页码： 55-61,68,126

收录情况： 北大核心

摘要： 为了查明山东省某养猪场水疱性传染病的病原体，试验采集了该养猪场猪只的水疱皮病料，并采用RT-PCR、病毒分离纯化、基因测序及分子生物学分析等方法对样品进行了病毒分离、鉴定和全基因组序列测定。结果表明：确诊该养猪场猪只发生水疱性传染病的病因为A型塞内卡谷病毒（SVA）感染，同时排除了猪口蹄疫病毒和猪水疱病病毒混合感染的情况，并成功分离到一株SVA,命名为SDMY-CH-2021株。该分离株在BHK-21细胞中盲传3次可引起明显的致细胞病变效应，噬斑纯化3代测定其TCID50为1×10-8.2/100μL;基因全长为7 388 bp,开放阅读框大小为6 546 bp,编码2 181个氨基酸。与参考毒株相比，该分离株与广州分离株CH-01-2015和武汉分离株HB-CH-2016亲缘关系较近；VP1蛋白氨基酸序列与美国首个分离株SVV-001的VP1蛋白氨基酸序列相似性最低，为92.5%;VP1蛋白存在9个B细胞线性抗原表位，相较于参考毒株VP1蛋白的氨基酸序列存在多处突变及缺失。说明分离株SDMY-CH-2021发生了部分基因变异。

分类号： S852.65

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