杜鹃花RsSnRK基因家族鉴定及表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王莲

作者： 王莲;张小娟;王华;贾素琦;李怡珊;徐婉婷;任爱华

作者机构：

关键词： 杜鹃花;RsSnRK基因家族;生物信息学;干旱胁迫;表达分析

期刊名称： 安徽农业大学学报

ISSN： 1672-352X

年卷期： 2024 年 51 卷 006 期

页码： 967-975

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探究杜鹃花(Rhododendronsimsii)蔗糖非酵解Ⅰ型相关蛋白激酶(sucrosenon-fermenting-1-related protein kinase,SnRK)对非生物胁迫的响应，基于杜鹃花基因组数据，利用生物信息学方法对RsSnRKs进行筛选鉴定和分析，并运用实时荧光定量PCR技术(RT-qPCR)检测该家族基因对干旱胁迫的响应情况。结果鉴定出杜鹃花RsSnRK基因家族共有3个亚族19个成员，它们编码的蛋白均为亲水蛋白，长度为362～555氨基酸，等电点为4.80～9.27，相对分子质量为41 025.65～62 951.44 Da，二级结构以α-螺旋和不规则卷曲为主，预测其主要位于细胞核或细胞质中。Motif和顺式作用元件分析发现，RsSnRKs同一亚家族基因具有相似的结构和基序，且RsSnRKs上游2 000 bp含大量的光响应、激素响应和非生物胁迫响应等元件。共线性分析发现，杜鹃花RsSnRK2/RsSnRK14在内的4组共线性对基因进化选择压力值均小于1，受纯化选择；此外，10个RsSnRKs与15个拟南芥AtSnRKs存在19条共线性关系。RT-qPCR分析发现，杜鹃花RsSnRK第Ⅱ亚家族成员RsSnRK7、RsSnRK9和RsSnRK13的相对表达量随着干旱程度加重而明显上调，复水后又显著下调表达，说明杜鹃花RsSnRKs能够积极响应干旱胁迫。结果为进一步探索杜鹃花RsSnRKs基因功能奠定基础，并为杜鹃花抗旱基因的筛选提供理论依据。

分类号： S685.21

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