整合宏基因组学分析生猪养殖粪污发酵过程中耐药基因的动态变化

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赵素君

作者： 赵素君;曹冶;李江凌;张金灵;刘锐;王秋实;于吉锋

作者机构：

关键词： 宏基因组学;粪污;发酵;耐药基因

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2023 年 003 期

页码： 655-664

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】探究生猪养殖粪污在堆肥过程中耐药基因的消减规律。【方法】以猪粪和菌渣为发酵原料，进行有氧堆肥处理，在堆肥第1、4、8、12、16、22、29天，进行上、中、下分层多点采样，提取总DNA构建文库，经定量和检测合格后，进行宏基因组测序分析。通过宏基因组学方法对堆肥过程中耐药基因的动态变化进行分析。【结果】堆肥期间共发现613个耐药基因，分别对32类抗生素产生耐药。其中，丰度较高的抗生素分别为青霉烷类抗生素（Penam）、头孢菌素类抗生素（Cephalosporin）、氨基糖苷类抗生素（Aminoglycoside antibiotic）、磷霉素类抗生素（Fosfomycin）、糖肽类抗生素（Glycopeptide antibiotic）和四环素类抗生素（Tetracycline antibiotic）,这与现实中常用的抗生素种类相吻合。分析发现耐药基因的消减出现2个峰值，第一个峰值出现在试验起始时，在第4天迅速下降，然后在第12天（对照组）和第8天（实验组）达到第二个峰值，随着细菌的自然凋亡，耐药基因的丰度又下降到低值，慢慢消减下去。【结论】在堆肥过程中，生猪养殖粪污中耐药基因丰度呈现波动式消减。

分类号： S141.4%X713

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