用于羊草基因分型的SNP分子标记技术研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 侯莉娟

作者： 侯莉娟;齐晓;齐冬梅;陈双燕;刘公社

作者机构：

关键词： 羊草;转录组;SNP标记;HRM基因分型;指纹图谱

期刊名称： 草业学报

ISSN： 1004-5759

年卷期： 2016 年 25 卷 02 期

页码： 105-113

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以我国广泛分布的多年生优势禾本科牧草羊草为研究材料,针对羊草目前尚无SNP标记技术的报道,基于实验室已有的转录组数据,挖掘其中的SNP分子标记,建立一种利用高分辨率熔解曲线(high-resolution melting,HRM)进行羊草SNP基因分型的方法。结果表明,从羊草转录组数据中获得41843个SNPs,转换的数量是颠换数量的2倍;建立了基于SNP的HRM基因分型方法,设计了112对SNP引物,其中有98对(87.5%)能扩增出明亮单一条带,扩增条带大小符合预期的有72对(64.29%),适宜进行HRM基因分型的引物有46对,占41.07%;用其中的7对引物可将羊草48份种质区分开,并绘制出指纹图谱。通过对部分HRM基因分型结果进行测序验证,表明测序分析的基因型结果与HRM基因分型结果一致,证明HRM基因分型结果是可靠的。本研究首次建立的基于SNP的HRM基因分型方法,可用于羊草种质资源的指纹图谱绘制、育种亲本的选配、基因关联分析、分子标记辅助育种、功能分子标记开发、新品种的保护等育种工作。

分类号： S543.9

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