绿豆VrRHF基因克隆及其生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 任欣雨

作者： 任欣雨;范保杰;王珅;时会影;沈颖超;田静;郭振清;刘长友

作者机构：

关键词： 绿豆;Vr RHF;基因克隆;生物信息学分析

期刊名称： 河北科技师范学院学报

ISSN： 1672-7983

年卷期： 2025 年 39 卷 002 期

页码： 7-11,28

摘要： 为了探究锌指蛋白基因（Vr RHF）在抗感豆象绿豆材料中的等位变异情况,本次研究从抗豆象栽培绿豆种质V1128和感豆象绿豆品种冀绿7号中分离了Vr RHF等位基因的c DNA序列,对其基因序列、氨基酸组成、蛋白质的理化特性及跨膜结构等方面展开生物信息学研究。结果表明,Vr RHF-a（来源于V1128）和Vr RHF-b（来源于冀绿7号）的c DNA全长序列分别为701bp和699bp,最大开放阅读框均为462bp,编码153个氨基酸,2个等位基因间存在1处In/Del和7个SNP,其中编码区存在6个SNP。2个基因编码的氨基酸序列存在5个变异位点。Vr RHF-a和Vr RHF-b蛋白分子式不同,分别为C756H1159N209O225S13和C751H1189N209O224S14,相对应分子量分别为17228.85Da和17178.81Da,且Vr RHF-a的等电点低于Vr RHF-b。Vr RHF-a表现为不稳定的疏水蛋白,而Vr RHF-b表现为稳定的疏水蛋白;二者不含信号肽,均为非分泌蛋白;二者各自拥有一个跨膜区域。通过蛋白质三级结构的预测分析,发现绿豆Vr RHF蛋白与大豆的指环形E3泛素连接酶（K7KKW4.1.A）在结构上最为相似。

分类号： S522%Q943.2

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