多粘类芽孢杆菌NPDY05-8的全基因组序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 邓云

作者： 邓云;陈泳和;陈春花;谢冬容;刘端华;饶溶晖;苏妍;许卿;阮宏椿

作者机构：

关键词： 多粘类芽孢杆菌;全基因组;碳水化合物相关酶;次级代谢产物;杀镰刀菌B

期刊名称： 福建农业学报

ISSN： 1008-0384

年卷期： 2025 年 40 卷 007 期

页码： 706-715

收录情况： CSCD

摘要： [目的]多粘类芽孢杆菌NPDY05-8是一株对小麦赤霉病、玉米茎基腐病有防治效果的有益菌.为了解其抗病机制,利用基因组测序技术解析该菌株的基因结构特征,明确其基因功能,分析其次级代谢产物,为该菌株的开发利用提供依据.[方法]采用平板对峙法分析菌株的抑菌率,并基于三代Nonopore和二代Illumina测序技术平台进行测序及组装,进行基因功能预测与注释.[结果]多粘类芽孢杆菌NPDY05-8对 19种病原真菌均有不同程度的拮抗作用,抑菌率在 62.00%~92.00%.基因组测序结果显示基因组总长度为 5 132 538 bp,G+C含量为45.63%,预测到 5 151个基因,4 949个蛋白质编码序列,含有 1个质粒,大小为 226 178 bp.分别有 3 902、3 489和1 391个基因在COG、GO和KEGG数据库中提取到注释信息.同时,还预测得到 209个碳水化合物相关酶和 11个次级代谢产物合成基因簇.[结论]NPDY05-8拥有丰富的碳水化合物相关酶,含纤维素酶基因 4个,合成的次级代谢产物的基因簇包含fusaricidi B、surfactin、paenicidin B、bacitracin、aurantinin B、aurantinin C、aurantinin D等多种抗菌物质,拥有极大的开发潜力.

分类号： X172

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