奥利亚罗非鱼3种C型溶菌酶基因的克隆及其序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 禹绍国

作者： 禹绍国;叶星;张莉莉;田园园;劳海华;白俊杰;卢迈新

作者机构：

关键词： 奥利亚罗非鱼;C型溶菌酶;蛋白质高级结构

期刊名称： 农业生物技术学报

ISSN： 1674-7968

年卷期： 2010 年 18 卷 01 期

页码： 78-86

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究结合RT-PCR和RACE法获得了奥利亚罗非鱼(Oreochromis aureus)三种C型溶菌酶基因C-1,C-2和C-3的全长cDNA。3个基因的cDNA分别为581bp、662bp和695bp,各编码143、156和143个氨基酸(GenBank accession No:EU913095,EU913094和EU836689),相互间氨基酸序列的同源性在63.9%～67.8%之间。3个基因均具有与其它物种C型溶菌酶相同的8个保守半胱氨酸残基和2个活性位点Glu35和Asp52,可认为它们均为C型溶菌酶基因。在系统进化树中这3个基因首先与同属高等真骨鱼类的聚类,最后再与低等真骨鱼类的聚类,系统进化关系与传统鱼类分类地位相吻合,显示真骨鱼类C型溶菌酶的进化速度与物种的进化速度基本一致。蛋白分析软件分析显示这3个基因均具有C型溶菌酶的典型结构、相似的蛋白二、三级结构,推测应具有与C型溶菌酶相似的生理功能。但3个基因氨基酸序列间存在一定差异,其中C-1的等电点较低且碱性氨基酸较少,因此3种溶菌酶可能具有生理功能上的差异与分工。

分类号： S917.4

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