基于COI基因分析7个罗非鱼群体的遗传变异

文献类型： 中文期刊

第一作者： 姜冰洁

作者： 姜冰洁;傅建军;朱文彬;王兰梅;方敏;董在杰

作者机构：

关键词： 罗非鱼;COI基因;群体;遗传多样性

期刊名称： 上海海洋大学学报

ISSN：

年卷期： 2019 年 006 期

页码： 827-834

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了研究罗非鱼群体的遗传多样性及其系统进化关系,以尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)、奥利亚罗非鱼(O.aureus)、莫桑比克罗非鱼(O.mossambicus)、吉富罗非鱼(GIFT)和3种红罗非鱼(中国台湾红罗非鱼、马来西亚红罗非鱼、以色列红罗非鱼)7个群体为材料,对其线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(COI)的序列进行PCR扩增和序列比对,分析7个罗非鱼群体的遗传变异情况.在324个样品中检测出180个多态性位点和98个单倍型,平均单倍型多样性为0.944,核苷酸多样性为0.036.中性检验Tajima's D值显示GIFT、莫桑比克罗非鱼和奥利亚罗非鱼群体在经历瓶颈效应和/或纯化选择后种群规模扩大.7个罗非鱼群体间的遗传距离为0.000~0.071,种群遗传分化指数(Fst)值为0.016~0.994.AMOVA分析显示,大多数遗传变异来自群体间(70.78%).研究还发现,本实验中的奥利亚罗非鱼遗传多样性最低,其余6个群体的遗传多样性较丰富.利用COI基因对7个罗非鱼群体的遗传结构进行分析,丰富了罗非鱼种群特别是红罗非鱼的遗传背景数据,对其种质资源利用具有一定的指导意义.

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