香蕉根系均一化全长cDNA文库的构建和鉴定

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王卓

作者： 王卓;殷晓敏;王家保;徐碧玉;金志强

作者机构：

关键词： 香蕉;根系;均一化;cDNA文库;基因;表达

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2011 年 38 卷 09 期

页码： 1667-1674

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以香蕉幼苗根系为材料,利用DSN(duplex-specific nuclease)均一化技术与SMART(switching mechanismat5′end of RNA transcript)技术相结合,构建香蕉根系均一化全长cDNA文库。经检测,初级文库滴度1.1×106cfu·mL-1,库容5×106个独立克隆,重组率大于95%,插入片段平均长度大于1kb,表明文库质量较好。随机挑取192个克隆进行EST(expressed sequencetags)测序,成功获得179个高质量EST,含5个conting和174个singlet,冗余度仅为2.35%。小规模测序拼接后获得145个unigenes,对unigenes分析结果表明文库的可靠性好。从序列比对结果中挑选3个与其它植物同源的抗逆基因,利用RT-PCR方法进行了干旱、低温及盐胁迫条件下基因表达分析,结果显示这3个基因在不同的逆境下差异表达。

分类号： S668.1

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