中国辣椒BCAT基因家族鉴定、表达分析及克隆
文献类型: 中文期刊
第一作者: 谢炳春
作者: 谢炳春;黄俊霖;温松森;李涛;李颖;徐小万;徐晓美;吴智明;衡周
作者机构:
关键词: 中国辣椒;支链氨基酸;生物信息学;表达特征;基因克隆
期刊名称: 广东农业科学
ISSN: 1004-874X
年卷期: 2022 年 49 卷 012 期
页码: 34-43
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: [目的]了解中国辣椒(Capsicum chinense Jacq.)BCAT基因家族成员的分布、性质及表达模式.中国辣椒是辣椒的5个主要栽培种之一,果实通常具有由支链酯类形成的浓郁果香.支链氨基酸转氨酶(BCAT,Branched-chain Aminotransferase)负责催化支链氨基酸合成相应2-氧代酸,是催化合成支链酯类的第一步反应酶.[方法]使用生物信息学分析和实时荧光定量PCR等方法对中国辣椒的BCAT基因家族成员进行鉴定、表达分析和克隆.[结果]获得5个BCAT基因家族成员,分别命名为CcBCAT1、CcBCAT2、CcBCAT3、CcBCAT4和CcBCAT5,随后对其进行生物信息学分析并克隆CcBCAT1~CcBCAT4.生物信息学分析显示,这些基因分布于辣椒的4条染色体上,蛋白均为亲水性蛋白,氨基酸长度在184~557 aa,分子量为20.29~89.60 ku,等电点为5.57~8.34.亚细胞定位预测结果显示,CcBCAT1定位于叶绿体和线粒体,其他基因家族成员均位于叶绿体.CcBCATs基因时空表达分析显示,CcBCAT1-4基因具有组织表达特异性,CcBCAT2~CcBCAT4相对表达量随着辣椒的成熟呈现逐步上升的趋势,其中CcBCAT4最为明显、CcBCAT1则相反、CcBCAT5未检测到表达.[结论]明确中国辣椒BCAT基因家族的表达模式,推测CcBCAT4参与辣椒果实相关次生代谢物合成.
分类号: S641.3
- 相关文献
[1]中国辣椒AAT基因家族的鉴定及表达分析. 衡周,叶楚,方健敏,杨静,徐小万,徐晓美,李涛,王恒明. 2023
[2]猪NR1H3基因可变剪接体的克隆及表达特性研究. 张雪莲,晋大鹏,吴怡琦,李文霞,秦本源,蔡春波,高鹏飞,郭晓红,李步高,曹果清. 2020
[3]马身猪CD63基因CDS区的克隆、表达及生物信息学分析. 张雪莲,晋大鹏,刘敏,吴怡琦,李文霞,秦本源,蔡春波,高鹏飞,郭晓红,李步高,曹果清. 2021
[4]青花菜BoDof5.3基因的克隆及渍水胁迫表达特征分析. 裴徐梨,荆赞革,徐境,唐征,宋波. 2020
[5]家蚕微孢子虫水通道蛋白基因NbAQP的克隆及表达特征分析. 王玮,陈功,彭祥然,李孝良,唐旭东. 2016
[6]中华鳖Wnt4基因克隆及表达分析. 张英萍,凌晨,王利华,沙航,邹桂伟,胥焘,罗相忠,梁宏伟. 2020
[7]黄颡鱼生长抑素基因的克隆及表达谱分析. 梁宏伟,曹磊,李忠,邹桂伟. 2015
[8]黄条鰤MSTN基因的克隆及其在早期发育中的表达特征. 史宝,曹亚男,柳学周,孙冉冉,徐永江,王滨,姜燕. 2021
[9]魁蚶(Scapharca broughtonii)血红蛋白Ⅰ基因克隆及表达特征. 赵庆,吴彪,刘志鸿,孙秀俊,周丽青,杨爱国,张高伟. 2019
[10]杜梨PbPEAMT的克隆、序列分析及表达特征. 李慧,丛郁,常有宏,蔺经,盛宝龙. 2012
[11]温郁金萜类合酶基因CwTPS4的克隆和表达特征. 张玉秀,卢丽兰,王慧针,叶梦瑶,刘培卫. 2021
[12]桑树二氢黄酮醇-4-还原酶和花青素合酶基因在桑椹中的表达谱及其与花青素含量的关系. 王如凤,苗珂,曹方园,方荣俊,潘刚,赵卫国,张林,程嘉翎,刘利. 2019
[13]桑树TIR1基因的克隆及在组织器官和扦插生根过程的表达分析. 唐壮,杜伟,李小玉,程嘉翎. 2014
[14]甘蓝型油菜GPAT9基因克隆与生物信息学分析. 刘少锋,邬贤梦,官春云,熊兴华. 2016
[15]中华蜜蜂气味结合蛋白基因AcerOBP14的克隆及时空表达. 杜亚丽,张中印,潘建芳,王树杰,杨爽,赵慧婷,姜玉锁. 2016
[16]无芒隐子草SAMS1基因的克隆及干旱胁迫下的表达分析. 孔令芳,张吉宇,刘志鹏,王彦荣. 2013
[17]中华蜜蜂GABARAP基因克隆、生物信息学分析及原核表达载体的构建. 于慧敏,吴鹏杰,李南南,谭静,徐书法,武江利. 2022
[18]小麦逆境胁迫相关基因TaCBL7的克隆、生物信息学及表达特性分析. 龙翔宇,蒲至恩,郑科,刘泽厚. 2013
[19]无芒隐子草CsPEAMT基因克隆及表达特性分析. 段珍,张吉宇,狄红艳,霍雅馨. 2014
[20]烟草NtMYB44b转录因子基因克隆以及生物信息学和表达分析. 余婧,郭玉双,雷波,张孝廉,赵德刚. 2020
作者其他论文 更多>>
-
板栗新品种'燕栗4号'
作者:张树航;李颖;郭燕;张馨方;范丽颖;刘金雨;王广鹏;熊永斌
关键词:板栗;品种;晚熟
-
残膜捡拾打包联合作业技术
作者:康建明;彭强吉;李涛;张宁宁;张春艳;王小瑜
关键词:残膜捡拾打包;智能化起膜;清洁捡拾技术;残膜压缩成型技术
-
42%寡糖·硫磺悬浮剂对西瓜白粉病的田间防效
作者:李相煌;李涛;张曼丽;曾庆朝;梁艳琼;谭施北
关键词:寡糖·硫磺;西瓜;白粉病;防效
-
葡萄品种黑美人在成都地区引种表现及丰产栽培技术
作者:何琴;李涛;罗玲;李欣瑶;唐嘉玲;刘伟
关键词:黑美人;栽培技术;应用前景
-
不同抗螨性板栗差异次生代谢物筛选与分析
作者:张馨方;王广鹏;张树航;李颖;郭燕
关键词:板栗;针叶小爪螨;抗螨性;次生代谢物
-
基于WMAIP集成模型的华北冬小麦适宜播期与冬前积温下限研究
作者:陈先冠;冯利平;白慧卿;孙爽;李国强;程陈;江敏;李颖;赵锦
关键词:冬小麦;冬前积温下限;最迟播期;产量;水分利用效率;WMAIP
-
我国甘蔗用农药登记现状分析
作者:黄慧文;李德伟;梁菊菊;李涛;罗亚伟;覃振强
关键词:甘蔗;农药登记;有效成分;剂型