小麦叶片气孔相关性状全基因组关联分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 李璐琪
作者: 李璐琪;程宇坤;白斌;雷斌;耿洪伟
作者机构:
关键词: 小麦;气孔;全基因组关联分析;单倍型;候选基因
期刊名称: 作物学报
ISSN: 0496-3490
年卷期: 2025 年 51 卷 009 期
页码: 2266-2284
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 小麦气孔是调节光合作用和蒸腾作用的微观孔隙,对产量有着关键作用,了解小麦气孔性状的遗传机制,挖掘关于小麦气孔相关性状的候选基因对于提高小麦产量具有重要意义.本研究以 276 份冬小麦品种(系)为研究对象,在正常灌溉和干旱胁迫 2 个处理下,对小麦抽穗期和灌浆期的气孔密度、气孔平均面积、气孔所占比等叶片气孔相关性状进行测定,并结合 90K小麦芯片,对上述 3 个性状进行全基因组关联分析.研究结果显示,在不同水分处理条件下,小麦气孔相关性状在 2 个时期均表现出较大的表型变异,变异系数介于 0.06 至 0.28 之间.全基因组关联结果显示,共检测到 88 个位于除 4D的其他 20 条染色体上与气孔相关性状显著关联的位点(P<0.001),其中与气孔平均面积显著相关的稳定遗传位点有4个,分布于1B,3A,6A染色体上,可解释遗传变异为2.78%~6.55%,均在正常灌溉下的灌浆期检测到.在抽穗期和灌浆期同时检测到 2 个与气孔密度显著关联的位点,其中在正常灌溉下 6A染色体上检测到的位点 Ex_c69429_328,可解释表型变异为 2.31%~3.06%;在干旱胁迫下 4A 染色体上检测到的位点BS00064423_51,可解释表型变异的 4.40%~6.09%.在 1A、1B、3A、4A、5A、6A、6D染色体上检测到 8 个"一因多效"遗传位点,可解释表型变异的 1.25%~7.31%.对贡献率大于 5.00%且在 2 个环境或 2 个性状以上检测到位点进行单倍型分析,发现与气孔平均面积和气孔所占比显著相关的 wsnp_Ex_rep_c69627_68580121(R2=6.47%)位点存在Hap1、Hap2 两个单倍型,在 276 份品种(系)中含有Hap1(频率为 81.20%)单倍型品种(系)的气孔平均面积显著小于含有Hap2(18.80%)单倍型品种(系)的气孔平均面积(P<0.05),不同单倍型在不同麦区的占比不同,其中单倍型Hap1 在西南冬麦区出现的频率最高,单倍型Hap2 则在北部冬麦区出现的频率最高.对 2 个环境检测到的及"一因多效"的位点进行候选基因的挖掘,共筛选出 9 个与小麦气孔性状相关的候选基因,这些基因在气孔发育、光合作用和抗逆性等方面具有潜在功能,可作为进一步研究气孔相关性状的重要基因.
分类号: S512.1
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