水稻CIPK基因家族的鉴定及OsCIPK5受稻瘟病菌诱导的qRT-PCR分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 喻丝丝

作者： 喻丝丝;罗曦;连玲;许惠滨;陈丽萍;魏毅东;蔡秋华;谢华安;张建福

作者机构：

关键词： 水稻;CIPK;基因家族;OsCIPK5;稻瘟病菌;qRT-PCR

期刊名称： 福建农业学报

ISSN： 1008-0384

年卷期： 2019 年 011 期

页码： 1237-1245

收录情况： CSCD

摘要： [目的]植物通过启动一系列信号传导过程来应对外部环境,这些过程通常涉及多种蛋白激酶,包括钙调神经磷酸酶B样蛋白互作激酶(calcineurin B-like protein-interacting protein kinases, CIPKs).为更加清晰全面地了解水稻CIPK基因家族,本研究根据最新的基因组测序数据对水稻基因组中的CIPKs进行了鉴定.[方法]通过探讨拟南芥和水稻中CIPKs蛋白家族的结构特点,结合生物信息学和qRT-PCR技术系统分析水稻中CIPKs家族蛋白的结构.结合转录组数据,比较了粳稻云引受稻瘟病菌诱导后的表达情况.[结果]根据最新的水稻基因组数据,鉴定出31个水稻OsCIPK基因.系统发育树分析结果表明,31个OsCIPK基因可分为5个亚家族,这些亚家族具有不同的外显子-内含子和UTR的结构特点.从广谱抗稻瘟病品种粳稻云引受稻瘟病菌诱导的基因表达谱的趋势聚类中筛选出了OsCIPK5基因并对其进行了表达分析,结果表明,云引中OsCIPK5基因受稻瘟病菌的诱导表达.[结论]内含子缺失和片段重复在水稻OsCIPK基因家族的扩展中起到重要作用,同时OsCIPK5受到稻瘟病菌的诱导表达.

分类号： S435.111.41

  • 相关文献

[1]腰果CBF基因家族的鉴定及响应冷胁迫的表达模式. 崔恒久,曾教科,李雯,黄海杰,彭世清,郭冬,蒲金基,周永凯,李辉亮. 2024

[2]水稻OsCIPK10基因的克隆和功能分析. 章俊丽,杨鵾,张玉满,颜永胜,赵志强,方荣祥,孙宗修,傅亚萍,陈晓英. 2009

[3]水稻黑条矮缩病毒和水稻条纹叶枯病毒侵染下水稻qRT-PCR内参基因的筛选. 沈江锋,李俊敏,孙丽英,陈剑平. 2014

[4]环境变化对水稻osfh1突变体成蛋白家族表达的影响. 李斌,李明玉,杜志烨,汪开顺,肖凯,王鑫,石杨,姬红丽,陈稷,黄进. 2022

[5]水稻中富含亮氨酸的重复序列和核苷酸结合位点(LRR-NBS)基因家族的生物信息学分析. 孙学辉,路铁刚,贾士荣,黄大昉. 2004

[6]基因组水平上水稻受体激酶基因家族的生物信息学分析. 孙学辉,路铁刚,贾士荣,黄大昉. 2004

[7]水稻干扰素相关发育调节因子的生物信息学分析. 和亚男,李稳,尹俊雅,谢先芝. 2021

[8]水稻三结构域多铜氧化酶基因家族生物信息学分析. 谭炎宁,张超,殷小林,何强,肖应辉,邓华凤. 2019

[9]水稻磷脂酶D基因家族鉴定及表达分析. 曹华盛,李堂,熊亮,王福军,李曙光,顾海永,何高,梁世胡,罗文永. 2024

[10]稻瘟病菌(poyricularia oryzae)培养滤液毒性研究. 谢海呈,杨学辉. 1996

[11]水稻Pi2/9位点3个抗瘟基因的抗菌谱及稻瘟病菌遗传多样性分析. 王素华,李智强,文婷,梁毅. 2012

[12]利用稻瘟病菌粗毒素筛选水稻抗病突变体. 刘艳,迟铭,王宝祥,宋兆强,杨波,卢白关,李健,秦德荣,徐大勇. 2016

[13]河北省稻瘟病菌生理小种研究初报. 张淑平,潘勋,高俊全. 1992

[14]哈茨木霉NF9菌株对水稻的诱导抗病性. Nzojiyobiri Jean-Berchmans,徐同,宋凤鸣,沈瑛. 2003

[15]基于RNA-Seq的稻瘟病菌Δznf1突变体的表达谱分析. 岳晓凤,阙亚伟,王政逸. 2016

[16]云南省稻瘟病菌生理小种的组成和分布. 李成云,李家瑞,岩野正敬,藤田佳克. 1990

[17]水稻品种(系)对稻瘟病菌生理小种抗性谱测定的研究. 陈增建,刘水芳,刘亦学. 1992

[18]利用绿色荧光蛋白GFP研究稻瘟病菌与水稻的互作. 许有嫔,廖海澄,陈金华,罗櫞,宿加,邹成东,李伟滔,王静,马炳田,贺闽,陈学伟. 2017

[19]水稻品种慢瘟性研究. 孙国昌,施德,孙漱沅. 1993

[20]转铁蛋白基因增强水稻对氧化胁迫与稻瘟病菌的抗性. 程志强,郭泽建,徐晓晖,柴荣耀,李德葆. 2003

作者其他论文 更多>>

微信小程序