适用于大豆疫霉菌遗传分析的新EST-SSR标记

文献类型： 中文期刊

第一作者： 蔺宇

作者： 蔺宇;徐静静;王晓鸣;武小菲;李彦舫

作者机构：

关键词： 大豆疫霉菌;表达序列标签(EST);SSR标记;通用性

期刊名称： 中国农业科学

ISSN： 0578-1752

年卷期： 2008 年 41 卷 08 期

页码： 2294-2301

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】开发大豆疫霉菌SSR标记,为深入了解大豆疫霉菌遗传变异提供理想分析工具。【方法】用SSRIT软件对28197条大豆疫霉菌EST进行SSR搜索,选择含有SSR的合适EST设计、合成引物和PCR扩增。【结果】发现1454条EST含有SSR,其中3个碱基重复基元类型最多,有855个,占鉴定总数的54.3%。设计合成140对引物,用10个大豆疫霉菌菌株基因组DNA进行PCR检测,有111对引物(79.3%)扩增出SSR特征条带。通用性检测表明有33对引物在检测的1个或多个其它疫霉菌或腐霉菌中产生扩增产物。【结论】大豆疫霉菌EST含有丰富的SSR位点,本研究从EST中开发了111个新大豆疫霉菌SSR标记,可有效地用于大豆疫霉菌及其相关种的遗传变异研究。

分类号： S435.651

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