长穗偃麦草ThPLA基因的电子克隆和生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张宴萍

作者： 张宴萍;黄德华;李鹏;崔正勇;何方;闫百蔷

作者机构：

关键词： 长穗偃麦草;ThPLA基因;电子克隆;生物信息学

期刊名称： 种子

ISSN： 1001-4705

年卷期： 2024 年 008 期

页码： 112-118

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究基于长穗偃麦草高通量测序信息，利用电子克隆方法获得长穗偃麦草磷脂酶基因(ThPLA),结合生物信息学分析方法，从氨基酸理化性质、保守结构域、高级结构、亲水性/疏水性、跨膜结构域、同源性分析及功能表达等方面对该基因gDNA和编码蛋白进行了预测和分析。结果表明，ThPLA基因全长1 620 bp,编码539个氨基酸；与粗山羊草、野生二粒小麦、水稻和玉米的PLA蛋白亲缘关系最近；亚细胞定位和GO term预测ThPLA蛋白质位于叶绿体；综合基因表达预测和转录组数据结果，该基因可能在植物根部对盐胁迫做出响应。

分类号： S512.1

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