韭葱黄条病毒黑龙江分离物外壳蛋白基因克隆与序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张威

作者： 张威;白艳菊;张匀华;申宇;高艳玲;耿宏伟;范国权;孟宪欣

作者机构：

关键词： 韭葱黄条病毒;外壳蛋白;核苷酸;序列分析;亲缘关系

期刊名称： 东北农业大学学报

ISSN： 1005-9369

年卷期： 2010 年 41 卷 008 期

页码： 60-65

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 韭葱黄条病毒(Leek yellow stripe virus,LYSV)是大蒜上的重要病毒病害,几乎分布于全国所有大蒜种植区域,严重影响大蒜的产量和品质.对其建立RT-PCR分子检测体系以及对其外壳蛋白(CP)基因进行序列分析尤为重要.根据已报道的LYSV CP基因的核苷酸序列设计合成1对引物,以带毒植株总RNA为模板,应用RT-PCR方法,克隆了LYSV黑龙江分离物(LYSV-HLJ)CP基因全长cDNA序列.结果表明,LYSV-HLJCP基因全长885 bp,编码295个氨基酸残基;与GenBank中其他不同分离物的CP核苷酸序列同源性为79.7%~88.6%,氨基酸序列同源性为83.7%~93.1%.依据LYSV CP氨基酸序列建立系统进化树,将LYSV不同分离物划分为4个类群,LYSV-HLJ与韩国和巴西大蒜上的LYSV有较近的亲缘关系,同属于iv类,表现出一定的寄主相关性.

分类号： S436.33

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