绒山羊RORα基因2种亚型的结构与进化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 吴江鸿

作者： 吴江鸿;刘永志;孙海莲;张文广

作者机构：

关键词： 绒山羊;RORα基因;RACE;编码蛋白;进化

期刊名称： 中国农业大学学报

ISSN： 1007-4333

年卷期： 2012 年 17 卷 04 期

页码： 110-117

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为深入研究绒山羊RORα基因的结构及功能,利用cDNA末端快速扩增法(RACE)结合转录组获得了绒山羊(Capra hircus)维甲酸相关孤核受体(retinoic acid receptor-related orphan receptorα,RORα)基因的2个亚型:RORα1和RORα2(GenBank登录号分别是HM_061155和HM_358053)。序列分析表明,RORα1序列全长1 620bp,包括5′端非翻译区(untranslated region,UTR)29bp、3′端非翻译区211bp和开放阅读框(open reading frame,ORF)1 380bp,共编码459个氨基酸,分子质量约为52.3ku,理论等电点6.25。RORα2序列全长1 694bp,包括5′UTR 76bp、3′UTR 211bp和ORF 1 407bp,共编码468个氨基酸;与人RORα4的长度相同,相似性达99%,分子质量约为53.4ku,理论等电点为6.37。结果显示:1)RORα1氨基酸序列缺少大多数核受体具有的调节区(A/B区),预测的二级结构少一个β-折叠基序(YFV);2)RORα的DNA结合区到配体结合区部分属于纯化选择,A/B区在长度和序列方面变异都很大。

分类号： S827

  • 相关文献

[1]鸡堆型艾美耳球虫新基因的克隆与生物信息学分析. 阎晓菲,黄兵,韩红玉,杨斌,岳城,赵其平,姜连连,董辉. 2014

[2]牛病毒性腹泻-黏膜病核酸疫苗的研究现状. 姜玲玲,周思旋,徐洪忠. 2015

[3]鸡传染性贫血病毒分子生物学研究进展. 鄢明华,刘长军,王英珍,李秀丽. 2002

[4]猪带绦虫六钩蚴Ts01基因的克隆、表达与结构预测. 景志忠,窦永喜,蒙学莲,吴国华,骆学农,郑亚东,才学鹏. 2004

[5]柔嫩艾美耳球虫蛋白质二硫键异构酶基因的克隆、表达及免疫原性分析. 韩红玉,黄兵,林矫矫,赵其平,董辉,姜连连,徐梅倩,朱顺海. 2009

[6]猪痘病毒研究进展. 芦晓立,张强,颜新敏. 2012

[7]重大畜禽疫病病原大分子结构与功能研究进展. 谢庆阁. 2003

[8]猪繁殖与呼吸综合征病毒的分子生物学. 周盛华,崔尚金. 2008

[9]水貂毛色关联TYRP2基因编码区序列鉴定及比较基因组学分析. 宋兴超,刘琳玲,杨童奥,丛波,刘宗岳,彭英华. 2020

[10]猪繁殖与呼吸综合征病毒结构蛋白编码基因重叠区的分离. 余丹丹,孙志,王金勇,袁世山. 2007

[11]来源于嗜热真菌Achaetomiumsp.Xz8的高比活性多聚半乳糖醛酸酶及其应用研究. 涂涛,孟昆,柏映国,石鹏君,罗会颖,姚斌. 2013

[12]PRRSV感染性克隆的反向遗传操作：结构蛋白编码基因重叠区的分离. 余丹丹,孙志,王金勇,袁世山. 2007

[13]番鸭细小病毒病研究进展. 刘惠莉,李震,丁卫星,张利. 2001

[14]冠状病毒基因组及其编码蛋白. 刘惠莉 ,陆承平. 2004

[15]Bac-to-Bac杆状病毒系统在日本血吸虫SjPP基因表达中的应用. 姚利晓,陶丽红,林矫矫,杨冠珍,吴祥甫,蔡幼民. 2006

[16]捕食线虫性真菌—少孢节丛孢菌粘附蛋白基因的克隆及生物信息学分析. 陈双庆,孟庆玲,乔军,赵海龙,王国超,赵新霞,罗建勋,才学鹏. 2013

[17]猪囊尾蚴SLC10克隆的筛选及表达. 郑亚东,骆学农,窦永喜,侯俊玲,景志忠,才学鹏. 2004

[18]产气荚膜梭菌青海分离株α毒素基因克隆与核苷酸序列分析. 王光华,周继章,蔺国珍,郑福英,曹小安,韩文祥,杨良存,宋竹青,邱昌庆. 2009

[19]香蕉束顶病毒研究进展. 赵焕阁,牛胜鸟,华元刚,邱世明,王达新,刘志昕. 2006

[20]理想氨基酸模式下,十二指肠灌注葡萄糖对绒山羊被毛生长及其氨基酸组成影响的研究. 苏鹏程,魏丕芳,卢德勋. 2006

作者其他论文 更多>>

微信小程序