黄麻(Corchorus capsularis L.)干旱胁迫转录组初步分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 金关荣

作者： 金关荣;陈杰;安霞

作者机构：

关键词： 黄麻(Corchorus spp.);干旱胁迫;转录组;转录因子;简单序列重复

期刊名称： 分子植物育种

ISSN：

年卷期： 2020 年 023 期

页码：

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 黄麻(Corchorus spp.)是重要的纤维作物,全球种植面积仅次于棉花.在当前全球变暖和气候异常的趋势下,干旱对于作物减产的负面影响尤其凸显.因此,研究黄麻响应干旱胁迫的分子机理对于缓解该矛盾具有重要的作用.本研究采用二代测序技术,对干旱胁迫处理下的黄麻幼苗植株进行转录组测序,通过对原始测序数据进行质量控制,并利用Trinity和Corset等软件进行序列拼接,得到了高质量的测序和拼接结果.随后对拼接得到的基因进行功能注释和相关分析,共得到23 297条非冗余基因,其中包含386条编码分属于46个转录因子家族的基因.对基因序列进行简单序列重复(simple sequence repeat, SSR)分析,获得了所有非冗余基因以及转录因子对应的SSR信息.相关结果为后续针对黄麻响应干旱胁迫的相关研究提供了候选分子资源.

分类号： S563.4

  • 相关文献

[1]大田环境下玉米抗旱相关性状QTL定位. 曹钟洋,汤彬,李立. 2012

[2]低温胁迫下苦瓜叶片转录组差异基因分析及生理响应特征. 杜文丽,陈中钐,许端祥,徐同伟,高山,温庆放. 2021

[3]柚芽变株系类胡萝卜素代谢差异基因的转录组学分析. 潘鹤立,潘腾飞,佘文琴,徐世荣,李小婷,黄汉唐,陈源,吴少华,潘东明. 2020

[4]紫花苜蓿响应低温胁迫转录因子的鉴定及表达分析. 齐晓,闵学阳,张正社,孙启忠,刘文献. 2017

[5]基于转录组分析不同着色桃果皮花青苷表达模式与转录因子. 何平,李林光,王海波,常源升. 2019

[6]盐胁迫条件下花生转录因子表达分析. 赵小波,闫彩霞,李春娟,王娟,姜常松,单世华. 2017

[7]木豆响应低温胁迫差异表达基因分析. 唐军,丁西朋,陈志坚,马向丽,毕玉芬,郭凤根. 2022

[8]辣椒果实类胡萝卜素调控因子转录组和靶向代谢组分析. 段敏杰,李怡斐,王春萍,杨小苗,黄任中,黄启中,张世才. 2024

[9]旱胁迫和复水处理后马铃薯转录因子的转录组分析. 巩檑,张丽,聂峰杰,陈虞超,甘晓燕,石磊,宋玉霞,郭志乾,王峰. 2015

[10]低温胁迫下枇杷不同发育阶段的花果转录组比较分析. 徐红霞,周慧芬,李晓颖,姜路花,陈俊伟. 2021

[11]全基因组DNA甲基化和转录组联合分析鉴定杜梨耐盐相关转录因子. 李慧,张雨峰,李晓刚,王中华,蔺经,常有宏. 2023

[12]大蕉果实转录组学分析及类胡萝卜素合成相关基因的研究. 韩树全,罗立娜,魏鹏程,卢振亚,贺尔奇,刘凡值. 2024

[13]低氮胁迫下芝麻差异表达转录因子基因的分析. 张鹏钰,苏小雨,高桐梅,李丰,田媛,王东勇,卫双玲. 2023

[14]叶面喷施脱落酸对黄瓜果实品质的影响. 梁颖,张泽锦,王力明,唐丽,高佳. 2023

[15]秋茄低温胁迫转录组分析及脱落酸信号途径基因挖掘. 郭晋敏,杨升,刘星,王金旺,王文卿,陈秋夏. 2023

[16]菜心叶片响应高温胁迫的转录组分析及转录因子筛选. 庞强强,孙晓东,周曼,蔡兴来,陈贻诵,王亚强. 2024

[17]TaNAC提高转基因烟草的抗旱功能. 刘美英,冶晓芳,唐益苗,高世庆,张朝,赵昌平,陈学平. 2010

[18]玉米ZmNAC99基因的克隆及干旱诱导表达分析. 张丽,张庭,谭登峰,王军,韩兆雪. 2017

[19]干旱胁迫和复水处理后梭梭转录因子的转录组分析. 何江峰,王力伟,房永雨,王蕴华,王朝,刘红葵. 2020

[20]植物干旱胁迫的信号通路及相关转录因子研究进展. 王彬,陈敏氡,林亮,叶新如,朱海生,温庆放. 2020

作者其他论文 更多>>

微信小程序