基于转录组测序技术分析猪德尔塔冠状病毒诱导IPEC-J2细胞中自噬相关的变化

文献类型： 中文期刊

第一作者： 江珊

作者： 江珊;李秀丽;李富强;李程;陈建飞;张莉;任卫科;朱琪;冯力;鄢明华

作者机构：

关键词： 猪德尔塔冠状病毒;IPEC-J2细胞;转录组测序;细胞自噬;病毒复制

期刊名称： 中国兽医科学

ISSN： 1673-4696

年卷期： 2023 年 003 期

页码： 320-331

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了探究猪德尔塔冠状病毒（PDCoV）感染宿主细胞后诱导细胞中发生的自噬相关变化，建立了PDCoV感染IPEC-J2细胞模型，通过间接免疫荧光和荧光定量PCR试验确定PDCoV在细胞中显著增殖。利用转录组测序获得了IPEC-J2细胞感染模型和正常细胞中的全部表达基因15 393个。通过基因覆盖度和测序饱和度分析明确数据符合分析要求后，进一步筛选了PDCoV感染导致表达量发生显著变化的基因（差异基因）2 056个，其中自噬相关基因33个。采用荧光定量PCR方法检测12个自噬基因在细胞感染模型和正常细胞中的相对表达量，检测结果与高通量测序结果一致。通过GO功能和KEGG通路富集分析，明确差异基因主要富集的功能和信号通路，并重点展示了6条自噬相关信号通路。本研究初步展示了PDCoV在IPEC-J2细胞增殖过程中诱导细胞发生的自噬相关变化，为研究PDCoV通过诱导细胞自噬促进自身复制的分子机制提供了理论依据。

分类号： S852.651

  • 相关文献

[1]适应肠道细胞的猪德尔塔冠状病毒对仔猪的致病性分析. 石迎,陶洁,李本强,程靖华,刘惠莉. 2024

[2]鹅细小病毒诱导番鸭胚成纤细胞自噬. 王劭,程晓霞,肖世峰,林锋强,朱小丽,陈少莺,陈仕龙. 2023

[3]细胞自噬对牛病毒性腹泻病毒复制的影响. 宫晓炜,郑福英,陈启伟,刘永生,李兆才,周继章,才学鹏,殷宏. 2015

[4]番鸭小鹅瘟病毒感染诱导细胞自噬. 王劭,肖世峰,程晓霞,江丹丹,林锋强,朱小丽,陈少莺,陈仕龙. 2022

[5]鸭坦布苏病毒诱导细胞自噬并促进病毒复制的初步研究. 王俊勇,吉艳红,付钰广,朱启运. 2016

[6]基于转录组测序技术分析猪德尔塔冠状病毒感染ST细胞机制的初步研究. 谢永生,张昆丽,张建峰,贺东生. 2024

[7]2-甲氧基肉桂醛缓解猪IPEC-J2细胞氧化损伤的效果研究. 储蓄,甄虎,张军霞,王晶. 2023

[8]植物乳杆菌对大肠杆菌感染猪肠道上皮细胞形态、存活和免疫应答的影响. 曾燕霞,王四新,张伟,刘辉,张董燕,王雅民,季海峰,王晶. 2018

[9]植物乳杆菌活菌体和热灭活菌体对大肠杆菌黏附IPEC-J2细胞的影响. 曾燕霞,季海峰,王四新,刘辉,张董燕,张伟,王雅民,郑琛,王晶. 2017

[10]猪德尔塔冠状病毒RT-PCR检测方法的建立及应用. 郑丽,王利丽,路超,杨春蕾,李富强. 2017

[11]2016-2018年天津地区规模化猪场猪主要病毒性腹泻病原的调查与分析. 路超,田向学,李富强,任卫科,郑丽,张莉,王利丽,鄢明华. 2019

[12]猪德尔塔冠状病毒TaqMan荧光定量PCR检测方法的建立及应用. 江珊,李富强,李秀丽,王利丽,郑丽,张莉,路超,鄢明华. 2019

[13]猪德尔塔冠状病毒感染仔猪引起肠道组织病理学变化及其对致病相关因子的影响. 江珊,李秀丽,张莉,王利丽,李富强,路超,鄢明华. 2021

[14]猪流行性腹泻病毒与新发腹泻病毒混合感染分析. 焦文强,邢广旭,徐引弟,王丽,王治方,王克领. 2021

[15]猪德尔塔冠状病毒BJ株的分离鉴定与致病性分析. 刘秋歌,王洪峰,范前进,冯力,陈建飞. 2020

[16]菊苣酸对仔猪人工感染猪德尔塔冠状病毒的保护效果研究. 谢永生,牛佳伟,李松倍,陈一波,李玉静,易宏波,贺东生. 2022

[17]国内首株猪德尔塔冠状病毒(Porcine deltacoronavirus)的分离鉴定. 陈建飞,王潇博,焦贺勋,时洪艳,张鑫,刘建波,石达,冯力. 2016

[18]猪δ冠状病毒与猪流行性腹泻病毒的受体结合区融合表达及免疫原性分析. 仝力心,芦延珍,于瑞明,张莉萍,刘霞,王永录,杜晓华,刘新生. 2024

[19]猪德尔塔冠状病毒重组聚合酶扩增检测方法的建立与应用. 肖帅,刘新生,方玉珍,周鹏,张永光,王永录,魏彦明. 2019

[20]一例猪德尔塔冠状病毒病的诊断与防控. 赵海忠,李良华,宋忠旭,孙华,彭先文,梅书棋. 2019

作者其他论文 更多>>

微信小程序