口蹄疫病毒株AF72VP3的结构模拟与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈启伟

作者： 陈启伟;王永录;张永光;潘丽;方玉珍;蒋守田;吕建亮;周鹏;张中旺;张昱;张淑刚;杜进鑫;李正丰;王刚

作者机构：

关键词： 口蹄疫病毒;VP3结构蛋白;3D结构;B细胞表位

期刊名称： 微生物学通报

ISSN：

年卷期： 2009 年 11 期

页码： 1716-1722

收录情况： CSCD

摘要： 以口蹄疫病毒株AF72RNA为模板,反转录并扩增目的基因,PCR纯化产物与pGEMT-Easy载体连接并转化JM109菌株,用凝胶电泳、PCR和SpeⅠ/SphⅠ双酶切法鉴定为阳性的重组质粒进行测序。比对测序结果确定AF72VP3的核苷酸序列,利用同源建模的方法建立AF72VP3结构蛋白的3D结构,在此基础上,综合亲水性、可塑性、抗原指数以及表面可能性等参数预测AF72VP3结构蛋白的B细胞抗原表位。分析表明,口蹄疫病毒VP1、VP2、VP3和VP4在核苷酸水平上的变异率是无差异的(P>0.05);而它们在氨基酸水平上的变异率差异显著(P<0.05)。该毒株与20株源于GenBank...

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