玉米P5CS基因家族全基因组鉴定及生物信息学分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 刘俊宇
作者: 刘俊宇;张春宵;孙博;董菁;石创业;吴委林;李晓辉
作者机构:
关键词: 玉米;P5CS基因家族;生物信息学;盐碱胁迫;基因表达
期刊名称: 玉米科学
ISSN: 1005-0906
年卷期: 2025 年 33 卷 002 期
页码: 9-20
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 基于14个物种的P5CS家族基因构建系统进化树,深入分析模式作物拟南芥及玉米、高粱、水稻3个亲缘关系较近的禾本科物种P5CS家族成员的基因结构、保守基序及其蛋白质理化性质等,对玉米P5CS基因家族进行全基因组鉴定和系统的生物信息学分析.分别用200 mmol/L NaCl和100 mmol/L Na2CO3对郑58(抗)和昌7-2(感)的玉米幼苗进行盐、碱胁迫处理,在胁迫0h、1 d和3 d时取叶部及根部样品进行转录水平分析.结果表明,14个物种的P5CS家族成员在系统进化树划分为两个支系,推测可能至少来自两个共同的祖先基因;P5CS家族具有相似的基因结构和特殊的基因特征,玉米P5CS基因家族包括ZmP5CS1、ZmP5CS2和ZmP5CS3.盐碱胁迫下,ZmP5CS1和ZmP5CS3上调表达而ZmP5CS2下调表达,表明这3个基因可能通过不同的机制来响应胁迫伤害和参与脯氨酸合成.
分类号: S513.035.3
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