DNA条形码在鰤属鱼类物种鉴定和系统进化分析中的适用性

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王开杰

作者： 王开杰;徐永江;柳学周;崔爱君;姜燕;王滨;方璐

作者机构：

关键词： 鰤属鱼类;DNA条形码;遗传距离;系统进化树

期刊名称： 中国水产科学

ISSN： 1005-8737

年卷期： 2022 年 002 期

页码： 171-183

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了探讨线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ、Ⅱ （CO Ⅰ、CO Ⅱ）和16S rRNA基因在鰤属鱼类物种鉴定和群体划分中的适用性,在黄条鰤（Seriola lalandi）、髙体鰤（Seriola dumerili）、五条鰤（Seriola quinqueradiata）等鰤属鱼类中克隆了3种基因,并进行序列比对与系统进化分析。结果显示, CO Ⅰ、CO Ⅱ和16S rRNA的基因序列均表现出明显的A+T偏倚性; 16S rRNA序列最为保守,变异率仅为5.06%; CO Ⅰ序列的平均核苷酸差异数（k）和核酸多样性指数（Pi）高于CO Ⅱ和16S rRNA, CO Ⅱ的单倍型多样性指数最高, CO Ⅰ序列分化程度更高。比较了鰤属鱼类3种基因的扩增序列,发现CO Ⅰ、CO Ⅱ和16S rRNA均能对我国分布的3种鰤属鱼类进行有效鉴别。另外, CO Ⅰ、CO Ⅱ还可作为不同地理群体黄条鰤的鉴别DNA条形码,而16S rRNA对于不同地理群体的黄条鰤辨识能力不足。在鰤属鱼类中,基于CO Ⅰ、CO Ⅱ、16S rRNA基因计算的种间遗传距离都大于种内遗传距离的10倍以上,系统进化分析显示每个物种都形成单系,表明CO Ⅰ、CO Ⅱ、16S rRNA基因不仅可作为鰤属鱼类物种鉴定和多样性保护的有效DNA条形码, CO Ⅰ、CO Ⅱ还可作为黄条鰤不同地理种群划分和国际资源判别的依据。

分类号： S917.4

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