甜瓜V-ATPase家族基因鉴定及组织表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 高瑞娜

作者： 高瑞娜;高超;孙建磊;刘鹏;李帅;韩德果

作者机构：

关键词： 甜瓜;V-ATPase;基因家族;表达分析

期刊名称： 北方园艺

ISSN： 1001-0009

年卷期： 2025 年 016 期

页码： 1-9

收录情况： 北大核心

摘要： 以甜瓜自交系“B3”为试材，采用生物信息学方法，鉴定了甜瓜V-ATPase(VHA)家族基因，并对其理化性质、染色体定位、亚细胞定位、共线性、启动子顺式作用元件以及不同组织部位表达量进行了分析，以期为明确VHA功能及作用机理提供参考依据。结果表明：甜瓜VHA基因家族有20个成员，不均匀地分布于9条染色体上。亚细胞定位预测结果较为复杂，其分布于细胞膜、细胞核、液泡、叶绿体等多个部位。依据系统发育树分析，可以将甜瓜VHA基因家族划分为12个亚家族。甜瓜VHA家族成员启动子顺式作用元件分析结果表明，其成员含有光、生长素、脱落酸、水杨酸、赤霉素、茉莉酸甲酯、低温、厌氧诱导、干旱等响应元件。共线性分析显示，甜瓜和拟南芥物种间共线性基因有12对，而甜瓜物种内共线性仅有2对。保守结构域分析结果表明，每条蛋白序列所含有的保守基序数量和类型有所不同，内含子的数目在1～17个不等。组织表达分析结果表明，15个VHA家族基因在不同组织部位均有不同程度的表达，5个VHA基因未检测到表达。相较于花、根、茎、叶，大多数VHA家族成员在果实中表达较高，特别是MELO3C014920.2和MELO3C010992.2在果实发育不同时期均高度表达，表明其在甜瓜果实发育过程中起重要调控作用。

分类号： S652

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