西藏牛与三江牛心脏组织低氧适应相关circRNA分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 白佳灵

作者： 白佳灵;王会;钟金城;陈智华;柴志欣;王吉坤;王嘉博;武志娟;信金伟

作者机构：

关键词： 西藏牛;三江牛;心脏组织;circRNA;低氧适应性

期刊名称： 农业生物技术学报

ISSN： 1674-7968

年卷期： 2021 年 006 期

页码： 1121-1131

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 环状RNA （circle RNA, circ RNA）是一种共价封闭的内源性生物分子,在高原动物低氧适应性中具有重要作用。高通量测序技术以成本低、通量高与速度快等优势,在哺乳动物与人类疾病研究中广泛应用,然而目前对西藏牛（Bos taurus）高原适应性相关circ RNA的研究鲜有报道。本研究以西藏牛和三江牛为对象,选择对高原低氧环境敏感的心脏组织,使用Illumina Hi Seq TM 4000平台对西藏牛与三江牛心脏组织circ RNA进行测序,对其差异表达谱进行分析,并预测circ RNA-mi RNA-m RNA之间的靶向关系,构建circ RNA-mi RNA-m RNA可视化调控网络。在西藏牛和三江牛的6个样本中,共筛选得到差异表达circ RNA 283个,其中显著上调的278个,显著下调的5个;GO功能富集分析显示,其来源基因被注释到45个功能条目;KEGG信号通路（pathway）功能富集分析表明,其来源基因主要显著富集在泛素介导的蛋白水解通路和c GMP-PKG信号通路等通路;novelcirc018959与mi R-142-x、mi R-144-y、mi R-1908-x、mi R-2302-y、mi R-1273-y等mi RNA存在靶向关系,而这些mi RNA的靶基因中包括ECE1、NFATC1、CAST、COX7C等低氧适应性候选基因,推测novelcirc018959很可能参与西藏牛低氧适应性调控,其具体功能及调控机制有待进一步研究。本研究结果为深入揭示circ RNA在西藏牛高原低氧适应过程中的分子机制提供了基础数据支持。

分类号： S823

  • 相关文献

[1]超高效液相色谱-三重四极杆质谱法测定心脏组织中腺苷含量. 朱佐银,郭文博,赵含珂,王杰,杨俊花,周新丽. 2024

[2]藏猪内皮型一氧化氮合酶(eNOS)基因的表达与低氧适应分析. 张博,强巴央宗,李庆岗,杨玉增,王志秀,班冬梅,张浩. 2013

[3]影响西藏杂交改良牛泌乳性能因素的分析与建议. 李昕鹏,孔小艳,黄畅,旦增洛桑,赵丽,次仁罗布,白玛坚才,扎西罗布,索朗曲吉,巴桑珠扎. 2022

[4]西藏牛Y染色体USP9Y基因与mtDNA D-loop区遗传多态性研究. 夏小婷,马志杰,张成福,蓝贤勇,陈宏,雷初朝. 2017

[5]西藏牛和日喀则驼峰牛Y-SNPs遗传多样性及父系起源研究. 顿珠加才,张俸伟,夏小婷,宋恩亮,陈宏,雷初朝. 2017

[6]植物非编码RNA及其在甜菜中的应用研究. 李任任,吕春华,於丽华,耿贵. 2019

[7]基于全转录组测序的绵羊胚胎不同发育阶段骨骼肌circRNA的分析与鉴定. 石田培,王欣悦,侯浩宾,赵志达,尚明玉,张莉. 2020

[8]山羊环状RNA circ_ZCCHC24的鉴定和表达分析. 陶虎,何雷,熊琪,张年,刘洋,陈明新. 2019

[9]畜禽肌内脂肪沉积的基因调控及其作用机制. 汪凯歌,闫俊书,宦海琳. 2024

[10]野鸟源H9N2亚型流感病毒感染小鼠的ceRNA调控机制研究. 刘慧珍,姚秋成,高玉伟,葛叶. 2023

[11]circRNA研究及其在医学中的应用. 杨玉莹,王成坦,高蕊,甘尚权. 2019

[12]基于跨反向剪接位点引物特异性检测circRNA的PCR方法. 孙宝箴,全龙萍,康慧,姚玉新,沈甜,陈卫平,杜远鹏,高振. 2022

[13]高通量测序分析褐飞虱circRNA表达谱及其潜在功能. 于鑫滢,赵哲奇,闸雯俊. 2024

[14]植物环状RNA研究进展. 高振,骆萌,王磊,宋士任,赵丽萍,许文平,张才喜,王世平,马超. 2019

[15]circ-13267通过let-7-19/ERBB4通路调控蛋鸭卵泡颗粒细胞凋亡. 吴艳,张昊,梁振华,潘爱銮,申杰,蒲跃进,黄涛,皮劲松,杜金平. 2022

[16]非编码RNA调控畜禽肌内脂肪沉积的研究进展. 齐婧,谭娅,王婧,张静,赵春萍,张正群,史开志. 2022

[17]大白猪和莱芜猪肌内脂肪组织circRNAs的鉴定与分析. 李嫒,张秀秀,黄万龙,解领丽,苗向阳. 2018

作者其他论文 更多>>

微信小程序