向日葵HaFATA基因的生物信息学和表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 周菲

作者： 周菲

作者机构：

关键词： 向日葵;脂酰-酰基载体蛋白硫酯酶;脂肪酸;生物信息学;表达分析

期刊名称： 安徽农业科学

ISSN： 0517-6611

年卷期： 2024 年 52 卷 007 期

页码： 96-98

摘要： FATA编码脂酰-酰基载体蛋白硫酯酶A,将质体中以脂酰-ACP形式存在的脂肪酸水解成游离的脂酰-CoA和酰基载体蛋白.为了解向日葵HaFATA基因编码蛋白的结构、功能及基因表达特性,对HaFATA编码蛋白进行生物信息学和基因表达分析.预测HaFATA为碱性且为亲水性蛋白,二级结构主要是无规则卷曲,预测亚细胞定位于叶绿体.系统进化分析表明,HaFATA与同属菊科的莴苣(Lac-tuca sativa L.)和水飞蓟(Silybum marianum L.)FATA进化关系近,序列相似性分别为 90%、87%.HaFATA表达分析结果显示,HaFATA在向日葵种子中表达最高,其次为在管状花和叶中,在茎、舌状花和根中不表达,在发育的种子中,HaFATA除在开花后12 d表达相对较低,在其他6个发育时期表达均较高,表明其对于种子发育和油脂积累可能具有重要作用.

分类号： S565.5

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