大麻SSR标记的开发及指纹图谱的构建

文献类型: 中文期刊

第一作者: 信朋飞

作者: 信朋飞;臧巩固;赵立宁;高春生;程超华;唐蜻

作者机构:

关键词: 大麻;SSR;指纹图谱

期刊名称: 中国麻业科学

ISSN: 1671-3532

年卷期: 2014 年 36 卷 04 期

页码: 174-182

摘要: 表达序列标签(expressed sequence tags,EST)是开发SSR标记的重要资源。本研究从NCBI中大麻EST数据库中检索到1114个SSR,分布于989条EST序列中,占EST总数的7.66%。其中三、六核苷酸重复基元类型居多,分别占EST-SSR总数的39.84%和34.56%,统计得到三核苷酸重复类型47种,六核苷酸重复类型113种。利用部分EST-SSR序列设计49对SSR引物,其中40对引物有扩增产物,占所设计引物总数的81.63%。进一步用这些引物在24个大麻品种进行多态性检测,29对引物显示多态性,占可扩增引物的72.5%。利用E-7、E-8、E-11、E-18、E-21、E-39及E-48共7对引物构建了24份供试材料的SSR指纹图谱。本研究结果证明了基于大麻EST信息建立SSR标记是一种有效而又可行的方法,并且为这些品种的真伪鉴定和保护提供科学依据。

分类号: S563.3

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