内蒙古赤峰地区辣椒病毒种类鉴定及其遗传进化特征

文献类型： 中文期刊

第一作者： 周艳芳

作者： 周艳芳;王秀芝;张晓梅;罗香文;刘泽红;崔聪聪;孟令强;孙军玲

作者机构：

关键词： 内蒙古赤峰地区;辣椒病毒病;sRNA高通量测序;RT-PCR;复合侵染;系统发育分析

期刊名称： 福建农业学报

ISSN： 1008-0384

年卷期： 2024 年 39 卷 007 期

页码： 819-825

收录情况： CSCD

摘要： 【目的】系统检测内蒙古赤峰市辣椒主产区病毒发生种类，并分析病毒的遗传分化情况，以期为该地区辣椒病毒病精准防控提供理论依据。【方法】从内蒙古赤峰地区4个辣椒主产区采集疑似病毒侵染的辣椒样本47份，采用sRNA高通量测序技术结合生物信息学分析，以及常规RT-PCR检测，明确侵染辣椒的病毒种类及复合侵染情况；采用常规Sanger测序测定常规RT-PCR扩增片段序列，进行遗传进化分析。【结果】内蒙古赤峰地区4个辣椒主产区辣椒混合病样的sRNA高通量测序，共检测到6种病毒，常规RT-PCR共验证到其中4种病毒；4个地区病毒种类存在明显差异，松山区城子乡优势种类为蚕豆萎蔫病毒2(Broad bean wilt virus 2,BBWV2)和马铃薯Y病毒（Potato virus Y, PVY），喀喇沁旗锦山镇为PVY和辣椒轻斑驳病毒（Pepper mild mottle virus, PMMoV）；宁城县和喀喇沁旗西桥镇为BBWV2；复合侵染类型以2种病毒复合侵染为主，复合侵染率最高达61.54%。对测定的序列系统发育分析表明，赤峰地区4个辣椒产区的PMMoV和BBWV2存在遗传分化，PVY可能出现了新的遗传型。【结论】内蒙古赤峰地区不同辣椒主产区发生的病毒种类、检出率和病毒复合侵染种类均存在明显差异。

分类号： S436.418

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